• 12月21日 星期六

潘玉春,浙江大学动物科学院教授、博导,动物遗传育种专家

  潘玉春,山东省栖霞市人。现任浙江大学动物科院教授、博导。

一、研究方向

  长期以来,一直从事动物遗传育种研究,尤其是在两个方向:一是统计组学与生物信息学;二是功能组学与设计育种学。研究对象主要是猪、牛等重要食源动物。

  目前,重点研究领域有四:一是基于整体组学(Holo-Omics)数据的关联分析、选择方法与软件研发;二是基于整体组学数据的地方猪种遗传资源鉴别、评价、保护以及利用;三是引进猪种的常规育种与设计育种;四是奶牛的基因组选择。

潘玉春,浙江大学动物科学院教授、博导,动物遗传育种专家

潘玉春,浙江大学动物科学院教授、博导,动物遗传育种专家。

二、教授课程

  1、本科:生物统计学;家畜育种学

  2、硕士:数量遗传学

  3、博士:统计基因组学

三、教育简历

  1983年毕业于山东农业大学动物科学专业并获学士学位;

  1986年毕业于东北农业大学动物遗传育种专业并获硕士学位,同年留校任教;

  1991年获博士学位,1992年升副教授;

  1993年赴菲律宾国际养猪培训中心(ITCPH)访问学习;

  1996年升教授,2001年末调到上海交通大学;

  2006~2007年在美国North Carolina State University 访问学习;

  2020年初调到浙江大学。

潘玉春,浙江大学动物科学院教授、博导,动物遗传育种专家

浙江大学

四、社会兼职

  1、国家畜禽遗传资源委员会:自1996年成立国家畜禽遗传资源委员会以来,历任猪专业委员会秘书、委员、副主任委员、主任委员。2012年起又担任了大委员会的委员。参与了全国畜禽遗传资源规划、管理及新品种/配套系的审定,并担任农业农村部指定的多家国家级猪遗传资源保种场联系专家。

  2、全国生猪遗传改良计划:作为“农业部全国猪育种协作组”专家,参与了《全国生猪遗传改良计划》的制定及其启动后的大量技术培训和核心场遴选工作,并具体担任农业农村部指定的多家国家级核心育种场联系专家。

  3、国家畜禽良种联合攻关专家指导委员会:担任委员并兼地方猪种种质自主创新联合攻关组首席科学家。

  4、中国畜牧兽医学会:担任动物遗传育种分会副理事长、信息技术分会副理事长、养猪分会副理事长。

五、荣誉

  研究领域包括整体组学(Holo-Omics)分析方法、遗传资源管理以及猪、牛遗传改良。迄今为止,先后主持、参加各类课题60余项(其中主持国家自然科学基金10项、973课题1项、863课题1项、948课题2项、畜禽良种攻关课题1项以及上海市科委、农委课题8项),发表文章170多篇(其中SCI文章70余篇),出版专著、译著、教材8部,获发明专利8项、软件著作权18项,获上海市科技进步二等奖1项、教育部科技进步二等奖2项、农业部中华科技二等奖1项、农业部科技进步三等奖1项、农牧渔业丰收三等奖1项以及第5届遗传学应用于家畜生产世界大会(5thWCGALP)颁发的'青年科学奖(Young Scientist Scholarship)”。此外,还组建了“华东种猪遗传评估中心”,开发了“中国地方猪品种登记网络平台”,参与了遗传资源保护、猪新品种/配套系的审定以及《全国生猪遗传改良计划》启动后的各种技术培训、核心场遴选与现场指导工作。

潘玉春,浙江大学动物科学院教授、博导,动物遗传育种专家

潘玉春,浙江大学动物科学院教授、博导,动物遗传育种专家。

六、前期工作

  1、针对动物杂交试验,提出了正反交循环部分双列杂交试验设计方法,并对各种动物杂交试验系统地构建和开发了基于最优线性无偏预测(BLUP)的分析方法、软件。

  2、针对远交群体的基因组变异检测问题,开发了简化基因组测序平台GGRS1.0和与之相配套的基因型填补方法iBLUP。在此基础上,结合低深度全基因组重测序与基因型填补技术,进一步将其升级成全基因组基因型判型技术平台GGRS2.0。

  3、针对复杂性状遗传机制解析相关统计方法的假阳性、假阴性率高和基因组预测的准确度低、运算速度慢等关键问题,开发了高效的关联分析与基因组预后系列模型,主要包括候选基因集关联分析方法(CGSA)、旨在提高计算速度和统计效能的GWAS方法(SUPER)、旨在降低噪音与提高统计效能的经验贝叶斯统计方法(EB)等。

  4、针对地方猪种资源鉴别、评价、保护、利用问题,配合农业部与全国畜牧总站开发了“中国地方猪品种登记”网络平台;分析了江、浙、沪、鲁、皖、滇等40个品种、品系、类群的群体基因组结构与功能特异性,在一定程度上揭示了其种质特性,并挖掘了一系列功能性基因;对系统保种理论的实际应用开展了相关研究,提出了保种-选种指数,并进一步强调了管理(包括避免盲目引种、杂交等)的重要性及其具体做法;开展了基于浦东白猪、金华猪的两个配套系的培育。

  5、针对引进品种猪的遗传改良,建立了“华东种猪遗传评估中心”,并对实践中的生产性能测定、经济(育种)重要性确定及生长与免疫的遗传相关机制等问题进行了深入研究。

  6、针对奶牛育种问题,初步建立了“上海奶牛基因组选择体系”,包括参考群体、统计分析平台及基因型分型平台。

(此处已添加圈子卡片,请到今日头条客户端查看)七、在研课题

  1、国家自然科学基金面上项目“太湖流域地方地方猪种基因组保护方法研究(31772552)”,2018-2021,主持。

  2、国家自然科学基金面上项目“猪基因组杂交育种方法研究(31972534)”,2020-2023,主持。

  3、. 国家自然科学基金专项项目“非洲猪瘟疫情下我国猪种种质资源保护研究(31941007)”,2020-2022,主持。

  4、农业农村部畜禽良种联合攻关项目“地方猪种种质自主创新联合攻关”,2019-2022,首席科学家

潘玉春,浙江大学动物科学院教授、博导,动物遗传育种专家

浙江大学

八、近期文章(*通讯作者)

  1、Z. Wang, Q. Chen, Y. Yang, R. Liao, J. Zhao, Z. Zhang, Z. Chen, X. Zhang, M. Xue, H. Yang, Y. Zheng, Q. Wang* and Y. Pan*, 2015: Genetic diversity and population structure of six Chinese indigenous pig breeds in the Taihu Lake region revealed by sequencing data. Animal Genetics, 09/2015; 46(6).

  2、Rongrong Liao, Zhen Wang, Qiang Chen, Yingying Tu, Zhenliang Chen, Qianshan Wang, Changsuo Yang, Xiangzhe Zhang, Yuchun Pan*, 2015: An Efficient Genotyping Method in Chicken Based on Genome Reducing and Sequencing. PLoS ONE 10(8): e0137010.

  3、X.X. Xie, Y.F. Ma, Q.S. Wang, Z.L. Chen, R.R. Liao and Y.C. Pan*, 2015: Yeast CUP1 protects HeLa cells against copper-induced stress. Brazilian Journal of Medical and Biological Research, 00(00): 1-6, http://dx.doi.org/10.1590/1414-431x20153848

  4、Qishan Wang, Julong Wei, Yuchun Pan and Shizhong Xu, An Efficient Empirical Bayes Method for Genome-wide Association Studies. Journal of Animal Breeding and Genentics, 2015,1-11, doi:10.1111/jbg.12191.

  5、R. Liao, X. Zhang, Q. Chen, Z. Wang, Q. Wang, C. Yang and Y. Pan*, 2016: Genome-wide association study reveals novel variants for growth and egg traits in Dongxiang blue-shelled and White Leghorn chickens. Animal Genetics, 47(5):588-596. DOI: 10.1111/age.12456

  6、Z. Wang, Q. Chen, R. Liao, Z. Zhang, X. Zhang, X. Liu, M. Zhu, W. Zhang, M. Xue, H.Yang, Y. Zheng, Q. Wang and Y. Pan*, 2016: Genome-wide genetic variation discovery in Chinese Taihu pig breeds using next generation sequencing. Animal Genetics, DOI: 10.1111/age.12465

  7、Z. Zhang, Z. Wang, Y. Yang, J. Zhao, Q. Chen, R. Liao, Z. Chen, X. Zhang, M. Xue, H. Yang, Y. Zheng, Q. Wang and Y. Pan*, 2015: Identification of pleiotropic genes and gene sets underlying growth and immunity traits: a case study on Meishan pigs. Animal, 1-8, DOI: 10.1017/S1751731115002761

  8、Q. Xiao, Z. Zhang, H. Sun, Q. Wang* and Y. Pan*, 2016: Pudong White pig: a unique genetic resource disclosed by sequencing data. Animal, 1-8, DOI: 10.1017/S1751731116002494

  9、Q. Xiao, Z. Zhang, H. Sun, H. Yang, M. Xue, X. Liu, W. Zhang, Y. Zhen, M. Zhu, Q. Wang* and Y. Pan*, 2017: Genetic variation and genetic structure of five Chinese indigenous pig populations in Jiangsu Province revealed by sequencing data. Animal Genetics, DOI: 10.1111/age.12560

  10、Zhe Zhang, Peipei Ma, Qiumeng Li, Qian Xiao, Hao Sun, Babatunde Shittu Olasege, Qishan Wang* and Yuchun Pan*, 2018: Exploring the Genetic Correlation Between Growth and Immunity Based on Summary Statistics of Genome-Wide Association Studies. FRONTIERS IN GENETICS, doi:10.3389/fgene.2018.00393

潘玉春,浙江大学动物科学院教授、博导,动物遗传育种专家

浙江大学

  11、Zhe Zhang, Qian Xiao, Qian-qian Zhang, Hao Sun, Jiu-cheng Chen, Zheng-cao Li, Ming Xue, Pei-pei Ma, Hong-jie Yang, Ning-ying Xu, Qi-shan Wang* & Yu-chun Pan*, 2018: Genomic analysis reveals genes affecting distinct phenotypes among different Chinese and western pig breeds. SCIENTIFIC REPORTS, (2018)8:13352

  12、H. Sun, Z. Wang, Z. Zhang, Q. Xiao, S. Mawed, Z. Xu, X. Zhang, H. Yang, M. Zhu, M. Xue, X. Liu, W. Zhang, Y. Zhen, Q. Wang* and Y. Pan*, 2018: Genomic signatures reveal selection of characteristics within and between Meishan pig populations. ANIMAL GENETICS, 49, 119-126

  13、Zhenliang Chen, Yunqiu Yao, Peipei Ma, Qishan Wang*, Yuchun Pan*, 2018: Haplotype-based genome-wide association study identifies loci and candidate genes for milk yield in Holsteins. PLOS ONE, 13(2):e0192695

  14、Hao Sun, Babatunde Shittu Olasege, Zhong Xu, Qingbo Zhao, Peipei Ma, Qishan Wang, Shaoxiong Lu* and Yuchun Pan*, 2018: Genome-Wide and Trait-Specific Markers: A Perspective in Designing Conservation Programs. FRONTIERS IN GENETICS, 9:389

  15、Suo-Yu Zhang, Babatunde Shittu Olasege, Deng-Ying Liu, Qi-Shang Wang, Yu-Chun Pan*, Pei-Pei Ma*, 2018: The genetic connectedness calculated from genomic information and its effect on the accuracy of genomic prediction. PLOS ONE,13(7):e0201400.

  16、Qing-bo Zhao, Rong-rong Liao, Hao Sun, Zhe Zhang, Qi-shan Wang, Chang-suo Yang, Xiang-zhe Zhang* and Yu-chun Pan*, 2018: Identifying Genetic Differences Between Dongxiang Blue-Shelled and White Leghorn Chickens Using Sequencing Data. G3-GENES GENOMES GENETICS, 8(2):469-476

  17、Z. Wang, H. Sun, Q. Chen, X. Zhang, Q. Wang and Y. Pan*, 2018: A genome scan for selection signatures in Taihu pig breeds using next-generation sequencing. Animal, 1-9

  18、Hao Sun, Zhe Zhang, Babatunde Shittu Olasege, Zhong Xu, Qingbo Zhao, Peipei Ma, Qishan Wang*, Yuchun Pan*, 2018: Application of partial least squares in exploring the genome selection signatures between populations. Heredity (Edinb), 1-4

  19、Zhe Zhang, Qianqian Zhang, Qian Xiao, Hao Sun, Hongding Gao, Yumei Yang, Jiucheng Chen, Zhengcao Li, Ming Xue, Peipei Ma, Hongjie Yang, Ningying Xu, Qisha Wang* and Yuchun Pan*, 2018: Distribution of runs of homozygosity in Chinese and Western pig breeds evaluated by reduced-representation sequencing data. ANIMAL GENETICS, 49(6):579-591

  20、Zhong Xu, Hao Sun, Zhe Zhang, Qingbo Zhao, Babatunde Shittu Olasege, Qiumeng Li, Yang Yue, Peipei Ma, Xiangzhe Zhang, Qishan Wang* and Yuchun Pan*, 2019: Assessment of autozygosity derived from runs of homozygosity in Jinhua pigs disclosed by sequencing data. Frontiers in Genetics, 10:274, 28 March 2019

潘玉春,浙江大学动物科学院教授、博导,动物遗传育种专家

潘玉春,浙江大学动物科学院教授、博导,动物遗传育种专家。

  21、Zhong Xu, Hao Sun, Zhe Zhang, Cheng-Yue Zhang, Qing-bo Zhao, Qian Xiao, Babatunde Shittu Olasege, Pei-Pei Ma, Xiang-Zhe Zhang, Qi-Shang Wang*, and Yu-Chun Pan*, 2019: Selection signature reveals genes associated with susceptibility loci affecting respiratory disease due to pleiotropic and hitchhiking effect in Chinese indigenous pigs. Asian-Australasian Journal of Animal Sciences, Vol.00, No. 00:1-10 Month 2020

  22、Suoyu Zhang, Jinxin Zhang, Babatunde Shittu Olasege, Peipei Ma, Xiaotian Qiu, Hong Gao, Changcun Wang, Yuan Wang, Qin Zhang, Hongjie Yang, Zhigang Wang, Xiangdong Ding*, Yuchun Pan*, 2019: Estimation of genetic parameters for reproductive traits in connectedness groups of Duroc, Landrace and Yorkshire pigs in China. Journal of Animal Breeding and Genetics 2019;00:1-12.

  23、Qing-bo Zhao, Hao Sun, Zhe Zhang, Zhong Xu, Babatunde Shittu Olasege, Pei-pei Ma, Xiang-zhe Zhang, Qi-shan Wang* and Yu-chun Pan*, 2019: Exploring the Structure of Haplotype Blocks and Genetic Diversity in Chinese Indigenous Pig Populations for Conservation Purpose. Evolutionary Bioinformatics, 15:1-8

  24、B.S. Olasege, S. Zhang, Q. Zhao, D. Liu, H. Sun, Q. Wang, P. Ma* and Y. Pan*, 2019: Genetic parameter estimates for body conformation traits using composite index, principal component, and factor analysis. J. Dairy Sci. https://doi.org/10.3168/jds.2018-15561

  25、XU ZHONG, SUN HAO, ZHANG ZHE, ZHAO Qing-bo, Babatunde Shittu Olasege, LI Qiu-meng, YUE Yang, MA Pei-pei, ZHANG Xiang-zhe, WANG Qi-shan*, PAN Yu-chun*, 2019: Genome-wide detection of selective signatures in a Jinhua pig population. Journal of Integrative Agriculture, 18(0):2-10

  26、Dengying Liu, Zhenliang Chen, Zhe Zhang, Hao Sun, Peipei Ma, Kai Zhu, Guanglei Liu, Qishan Wang, and Yuchun Pan*, 2019: Detection of genome-wide structural variations in the Shanghai Holstein cattle population using next-generation sequencing. Asian-Australasian Journal of Animal Sciences, Vol. 32, No. 3:320-333 March 2019 https://doi.org/10.5713/ajas.18.0204

(此处已添加圈子卡片,请到今日头条客户端查看)九、近期学术报告

  1、Genomic conservation and application of pigs in the Taihu region of China. PAG ASIA, 2015.7.15,新加坡。

  2、基于基因组SNP的猪地方品种保护、选择以及利用。第一届猪业科技大会,2015.9.19,厦门。

  3、太湖流域地方品种猪基因组变异及其功能研究。日本养猪学会103回会议,2015.10.9,日本岐阜。

  4、在猪遗传改良中存在的几个问题。农业部第一期种猪生产性能测定培训班,2018.4.9,武汉。

  5、地方猪种开发中的五大关系。沙子岭猪特色产业发展高峰论坛,2018.12.20,湘潭。

  6、非洲猪瘟笼罩下的种猪繁育。农业农村部首届畜禽种业高峰论坛,2019.9.18,青岛。

  7、地方猪种遗传资源保护及其创新开发。农业农村部首届畜禽种业高峰论坛,2019.9.18,青岛。

  8、猪基因组保护: 优先序列。第三届中国猪业科技大会,2019.9.20,青岛。

  9、中国优质肉猪创新开发,沙子岭猪特色产业发展论坛,2020.1.15,湘潭。

中国各农业大学教授简介

  刘建新,浙江大学求是特聘教授、博导,反刍动物营养调控专家

  方维焕,浙江大学动科院副院长、博导,动物预防医学研究所所长

  杜爱芳(女),浙江大学动科院教授、博导、副院长,兽医一级学科负责人

  张微(女),中国农业大学教授、博导,反刍动物营养与饲料专家

  王昕(女),西北农林科技大学教授、博导,动物育种专家

  郝瑞荣(女),山西农业大学教授、博导,动物繁殖、生猪健康专家

  王楚端,博士、教授,中国农业大学动物科技学院

  罗军,博导,西北农林科技大学,副校长

  侯卓成,中国农业大学动物科技学院教授,家禽遗传育种专家

  敖长金,蒙古族,内蒙古农业大学教授、博导,动物科学院院长

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