• 12月20日 星期五

在老挝发现的与新冠病毒最接近的已知亲属

对中国和老挝蝙蝠的研究表明,东南亚是类似 SARS-CoV-2 的潜在危险病毒的热点地区。

在老挝发现的与新冠病毒最接近的已知亲属

科学家们在老挝的蝙蝠身上发现了三种病毒,与任何已知病毒相比,它们与 SARS-CoV-2 更相似。研究人员说,他们的部分遗传密码支持声称 COVID-19 背后的病毒具有自然起源——但他们的发现也引发了人们对有许多冠状病毒有可能感染人类的​​担忧。

英国格拉斯哥大学的病毒学家大卫罗伯逊称这一发现“令人着迷,而且相当可怕”。

未经同行评审的结果已发布在预印本服务器 Research Square 1上。特别令人担忧的是,新病毒含有与 SARS-CoV-2 几乎相同的受体结合结构域,因此可以感染人体细胞。受体结合域允许 SARS-CoV-2 附着在人体细胞表面的一种称为 ACE2 的受体上进入细胞。

为了做出这一发现,巴黎巴斯德研究所的病毒学家马克·埃洛伊特和他在法国和老挝的同事们在老挝北部的洞穴中采集了 645 只蝙蝠的唾液、粪便和尿液样本。在三种马蹄 ( Rhinolophus ) 蝙蝠物种中,他们发现病毒与 SARS-CoV-2 的同一性均超过 95%,他们将其命名为 BANAL-52、BANAL-103 和 BANAL-236。

自然来源

澳大利亚悉尼大学的病毒学家 Edward Holmes 说:“当 SARS-CoV-2 首次被测序时,受体结合域看起来并不像我们以前见过的任何东西。” 这使一些人猜测该病毒是在实验室中制造的。但他说,老挝冠状病毒证实了 SARS-CoV-2 的这些部分存在于自然界中。

“我比以往任何时候都更加确信 SARS-CoV-2 具有自然起源,”新加坡杜克-新加坡国立大学医学院的病毒学家 Linfa Wang 表示同意。

Alice Latinne 说,与在泰国2、柬埔寨3和中国南部云南4发现的 SARS-CoV-2 的亲属一起,该研究表明东南亚是“SARS-CoV-2 相关病毒的多样性热点”,河内越南野生动物保护协会的进化生物学家。

在他们研究的一个额外步骤中,Eloit 和他的团队在实验室中表明,这些病毒的受体结合域可以像 SARS-CoV-2 的一些早期变体一样有效地附着在人类细胞上的 ACE2 受体上。研究人员还在细胞中培养了 BANAL-236,Eloit 说他们现在将用它来研究病毒在动物模型中的致病性。

去年,研究人员描述了 SARS-CoV-2 的另一个近亲,称为 RaTG13,它是在云南的蝙蝠中发现的5。它与 SARS-CoV-2 总体上具有 96.1% 的相同性,这两种病毒可能在 40-70 年前有一个共同的祖先6。Eloit 说,BANAL-52 与 SARS-CoV-2 的同一性为 96.8%,而且所有三种新发现的病毒都有单独的部分,与任何其他病毒相比,它们与 SARS-CoV-2 的部分更相似。

Spyros Lytras 说,病毒通过称为重组的过程相互交换 RNA 块,BANAL-103 和 BANAL-52 中的一个部分可能与不到十年前的 SARS-CoV-2 部分共享一个祖先。格拉斯哥大学的病毒学家。“这些病毒重组得如此之多,以至于基因组的不同部分具有不同的进化历史,”他说。

缺少链接

研究人员说,老挝的研究提供了对大流行起源的深入了解,但仍然缺少链接。例如,老挝病毒在刺突蛋白上不包含所谓的弗林蛋白酶切割位点,该位点可进一步帮助 SARS-CoV-2 和其他冠状病毒进入人体细胞。

该研究也没有阐明病毒的祖先如何传播到中国中部的武汉,那里发现了第一批已知的 COVID-19 病例——或者病毒是否搭上了中间动物的便车。

答案可能来自于对东南亚更多的蝙蝠和其他野生动物进行采样,许多团体正在这样做。

另一份预印本也发布在 Research Square 上,尚未经过同行评审,它揭示了中国正在进行的工作7。在这项研究中,研究人员在 2016 年至 2021 年间在中国采集了约 13,000 只蝙蝠。但他们没有发现任何 SARS-CoV-2 的近亲,并得出结论认为这些“在中国蝙蝠中极为罕见”。

但其他研究人员质疑这一说法。“我强烈不同意 SARS-CoV-2 的亲属可能不会在中国蝙蝠中传播的说法,因为此类病毒已经在云南描述过,”Holmes 说。

该研究的通讯作者拒绝回应Nature关于研究结果的问题,因为该论文仍在审查中。

王说,这两项研究都强调了在中国以外地区增加抽样以帮助发现大流行起源的重要性。

自然 597 , 603 (2021)

doi:https://doi.org/10.1038/d41586-021-02596-2

参考:

  1. Temmam, S. et al. Preprint at Research Square https://doi.org/10.21203/rs.3.rs-871965/v1 (2021).
  2. Wacharapluesadee, S. et al. Nature Commun. 12, 972 (2021).
  3. PubMed Article Google Scholar
  4. Hul, V. et al. Preprint at bioRxiv https://doi.org/10.1101/2021.01.26.428212 (2021).
  5. Zhou, H. et al. Cell 184, 4380–4391 (2021).
  6. PubMed Article Google Scholar
  7. Zhou, P. et al. Nature 579, 270–273 (2020).
  8. PubMed Article Google Scholar
  9. Boni, M. F. et al. Nature Microbiol. 5, 1408–1417 (2020).
  10. PubMed Article Google Scholar
  11. Wu, Z. et al. Preprint at Research Square https://doi.org/10.21203/rs.3.rs-885194/v1 (2021).
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