1940年，裕仁天皇命令日军从菲律宾、新加坡、马来亚、荷属东印度(今印尼)和法属印度支那掠夺的部分财宝通过船队运回日本。这些宝藏储存在一些废弃矿井中，还有一些藏在长野县的群山里，准备用于战败时最后的顽抗。日本军方驱使数万名朝鲜劳工在那里挖掘了巨大的地下工事群，然后将他们秘密杀害，以防宝藏秘密泄漏。
1942年，日本在太平洋上的战事吃紧，美国海军在洋面上巡逻，击沉大量日本运输船，比如，被击沉的日本“阿波丸”运输舰竟装有黄金40吨，白金12吨，工业金刚石15万克拉。美军的巡逻使得为数众多的黄金等贵重物品无法通过海上运回日本。为了保护掠夺财富的安全，天皇命令“山百合”迅速将这批财宝登记注册，埋藏于菲律宾全境175处的“皇家藏宝点”。
1945年，美国军队逐渐逼近日军占领的菲律宾。当时，日本一度仍幻想与盟国实现有条件停战，并在战后保住对菲律宾的占领，这样的话便可以将这笔宝藏从容地运回日本。但是，日本人的企图没有得逞。面对紧急情况，日本法西斯分子开始做最后的黄金处理和保密工作。5月，日本“山百合”部分负责人安排“皇家藏宝点”的工程师们在菲律宾吕宋岛深山里的一个“8号地道”里举行了盛大的告别仪式。那个地道距离地面有67米，堆积着一排又一排的金条。
就在工程师们喝得酩酊大醉时，负责“皇家藏宝点”建设的日本菲律宾方面山下奉文大将和皇族成员们溜出了“8号地道”，用爆炸力极强的炸药封住了通道出口。这些工程师就这样与财宝一起被埋葬在地道中。这样，那些“皇家藏宝点”就成了外人不知道的秘密。3个月后，山下奉文向美国军队投降。
日本侵略军费尽心机，却百密一疏，在执行计划时留下了一个活口，他就是菲律宾人本·沃尔莫里斯。年轻时他曾给裕仁天皇的大侄子、明治天皇的孙子武田当过贴身男仆，而武田王子就是“皇家藏宝点”的负责人之一。当时，日本王子偶然萌生的同情心，使本·沃尔莫里斯在爆炸前离开，拣了一条命。后来，在一个秘密场合，本·沃尔莫里斯将日本在菲律宾藏有黄金的秘密告诉了美国人，但没有透露具体地点。
1945年9月2日，日本在菲律宾投降后，山下奉文因在马尼拉进行大规模种族大屠杀而被指控犯有战争罪。担任审判的美国官员已经从中央情报局那里获知了日本在菲律宾埋有财宝，于是在审判中曾千方百计获取其中的秘密。不过，山下在受审期间，没有真正招供，坚决不肯吐露财宝的秘密。然而，为山下奉文开车的司机小岛少佐却引起了美方审判人员的特别关注。在陆续找到更多的“皇室藏宝点”后，美国情报机构就派人悄悄地挖走了价值高达数十亿美元的金块、钻石和白金。无论是道格拉斯·麦克阿瑟将军，还是杜鲁门总统，从一开始就把挖掘这些藏宝点作为美国国家顶级机密。
美国战后获取的最大一笔黄金是在菲律宾的圣罗马纳。当日军在菲律宾节节败退时，菲律宾游击队曾发现他们将大批沉重的箱子运到一个山洞中，然后用炸药将出口封死。一名美国战略情报局的少校当时和游击队在一起，记住了藏宝地点。该特工在战后重新打开了这个山洞，发现箱子中全是黄金。
1945年到1948年之间，这批价值约几百亿美元的黄金被运到了美国，没有将其归还给东南亚国家的受害者，而是分别存入了42个国家的176家银行，其中瑞士联合银行日内瓦分行以“兰斯代尔”名义开出了一个拥有上百亿美元的黄金账户！战略情报局解散后，这笔巨大的财富被中央情报局接收，成为其账面外资金，其使用和支配不受任何监督。令人震惊的是，还有一部分黄金成为美国人的私财，其中最大的账户是以麦克阿瑟的儿子阿瑟·麦克阿瑟的名义在苏黎世的瑞士信贷银行开设的，数目高达近百吨的黄金，而美国前总统胡佛在瑞士信贷银行的私人账户上也有7.5吨黄金！寻找到大量宝藏大大增加了美国进行冷战的资本。
根据美国官方透露，杜鲁门政府把美国在亚洲找到的财宝，连同美国在欧洲搜罗到的德国法国斯所掠夺的财宝，合在一起作为"秘密政治行动基金"，用于冷战中与苏联对抗的费用。马科斯及其代理人经常都在伦敦、香港、悉尼等地的黄金市场上秘密出售大批黄金，有时一次卖出的金锭数量就高达10多吨，比已知的菲律宾所有的黄金储备还多。每隔一段时间，世界上规模最大的伦敦黄金交易所就会出现一次称为“马科斯黑鹰”的秘密买卖。根据已出售的数量估算，马科斯的黄金价值约上百亿美元。不过，马克斯总统在1986年被推翻后，黄金被迫转交给了美国。为了运这些黄金，美国动用了“艾森豪威尔”号航空母舰。
另外，还有许多人私自在菲律宾的山区中寻找日军埋藏的黄金。半个多世纪以来，日本在东南亚藏有黄金的秘密不断被解开，数量之巨足可见当初日本对亚洲掠夺之甚。被日本抢劫的对象除了日本侵略的国家，还包括被占领地区的个人、教堂、寺庙、银行、公司以及地下经济团体。在上世纪40年代末，有人曾估计，日本在东南亚地区获取的“战利品”近千亿美元，还有许多无法估价的奇珍异宝，这使亚洲人民蒙受了不可估量的损失。