新型冠状病毒(COVID-19)疫情蔓延全球,至今有超过160万人确诊、10万人丧生。有来自英国及德国的科学家利用基因网络技术,重塑病毒的初期演变路径。
美国国家科学院院刊(Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America,PNAS)前几日刊登一篇由英国剑桥大学遗传学家福斯特博士(Dr Peter Forster)及研究团队撰写报告,他们分析首160名确诊者的病毒基因组,经过排序后发现病毒曾有多次异变。
该批病毒基因组样本在去年12月24日至今年3月4日之间取得,研究团队以考古学DNA序列史前人口的技术,得出病毒演变成三个世系,他们以A、B、C分类。
研究指,被称为“人类最早病毒基因”的A系病毒,与蝙蝠及穿山甲身上发现的病毒非常接近,并在疫情最初爆发的武汉找到,令人意外的是,A系病毒却不是武汉最流行的类型。A系病毒主要在美国及澳大利亚患者身上发现,另外曾在武汉居住的美国人亦有同类型病毒。
而包括武汉在内的东亚地区患者身上的则主要是从A系两度异变而成B系病毒,但在东亚以外地区较少发现。
研究人员认为,之所以出现这种情况有两种可能。一是因为“奠基者效应”(Founder effect)的结果,即是指一小部分病毒独立形成新群体,反映基因出现樽颈情况;二是因为B系病毒可能在免疫学或环境上更适应大部分东亚人群,需要经过变异才可在东亚以外传播。且在目前的初步阶段,B系病毒在东亚的变种率较低。
至于C系病毒则是B系的“女儿”,在法国、意大利、瑞典及英国的前期病人身上都有找到,属欧洲的主要类型。报告指中国大陆的样本没发现这种病毒,但在新加坡、香港及韩国的样本找到。
研究亦指出,意大利其中一个最早的确诊个案是从德国首宗病例在1月27日传入,而另一名意大利初期患者则与新加坡群组有关。
福斯特称,利用演化网络分析病毒演变,有助找出其他COVID-19病毒的不明感染来源,从而找出阻止疫情扩散的方法。
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