X

“2019-nCov”科研动态信息汇编(2月3日)【中国科讯】

当前全国人民齐心协力抗击疫情,国家的应急防控工作也召唤着更多的科技工作者参与。中国科学院文献情报中心和武汉文献情报中心以习近平总书记重要指示精神和中央政治局常委会会议精神为指导,贯彻落实党中央、国务院关于做好新型冠状病毒感染的肺炎疫情防控工作决策部署,立足业务专长、发挥自身优势,提供全面、系统的高水平战略情报汇总,以期为科研攻关、科学研究、科学决策提供高水平参考。

特推出科研动态监测快报《"2019-nCov"科研动态信息汇编》(更新至2月3日,现开放PDF文件全文下载

信息名称

对武汉应对2019-nCoV爆发所采取出行限制措施的早期评估

01

时间:

2020年2月2日

02

机构或团队:

北京师范大学、牛津大学、加州大学戴维斯分校、清华大学、北京市疾病预防控制中心、北京微生物流行病研究所、香港大学、北京大学、北京市疾病预防控制中心、宾夕法尼亚州立大学、普林斯顿大学

03

事件概要:

北京师范大学等机构研究人员在medRxiv预印版平台发表论文“Early evaluation of the Wuhan City travel restrictions in response to the 2019 novel coronavirus outbreak”。

文章指出,中国首次报道了一种新型冠状病毒(2019-nCoV)的持续暴发,并已在全球蔓延。2020年1月23日,中国关闭了进出武汉的交通枢纽,以遏制疫情的暴发。武汉是主要的交通枢纽,拥有1100万居民。研究人员通过结合流行病学和人类流动性数据研究发现,旅行禁令使从武汉到中国其他城市的2019-nCoV传播速度减慢了2.91天(95%CI:2.54-3.29)。这种延误为建立和加强其他控制措施提供了时间,这些控制措施对于遏制该流行病至关重要。正在进行的2019-nCoV传播为研究旅行限制如何阻碍新兴传染病在空间上的传播提供了机会。

*注,本文为预印本论文手稿,是未经同行评审的初步报告,其观点仅供科研同行交流,并不是结论性内容,请使用者谨慎使用。

04

附件:

原文链接:

https://www.medrxiv.org/content/10.1101/2020.01.30.20019844v1

信息名称

2019-nCoV传播和控制的早期动力学:数学建模研究

01

时间:

2020年2月2日

02

机构或团队:

英国伦敦卫生与热带医学院

03

事件概要:

英国伦敦卫生与热带医学院研究人员在medRxiv预印版平台发表论文“Early dynamics of transmission and control of 2019-nCoV: a mathematical modelling study”。

文章指出,截至2020年1月30日,2019-nCoV的暴发已导致7818例2019-nCoV感染病例。了解感染的传播动态对于评估控制措施的有效性和在新地区发生持续传播的潜力至关重要。研究人员将随机传播模型与武汉市2019-nCoV病例和源自武汉的输出病例数据相结合,估计截至2020年1月23日该市的传播情况随时间的变化以及有症状的病例的可能患病率。根据这些估计,研究人员计算了新引入的病例将在其他地区爆发疫情的可能性。研究人员估计,从2020年12月中旬到2020年1月中旬,中值传染数R在1.6-2.9之间波动。与模型相比,美国、澳大利亚和法国有更多曾前往武汉旅行的确诊病例,并且估计到2020年1月23日武汉市实施出行限制时,武汉市共有29,500例(14,300-85,700例)有症状的病例。根据对R的估计,研究人员计算出在具有与武汉类似的传播潜力的地区,一旦引入的病例超过三个,在该人群中感染的机会就超过50%。研究结果表明,2019-nCoV在持续的人际传播方面具有巨大潜力,在2020年1月23日实施旅行限制之前,从武汉输出的病例可能有所增加。随着越来越多病例的国际流动,可能很多传播链最初无法建立,但最终仍可能导致新的爆发。

*注,本文为预印本论文手稿,是未经同行评审的初步报告,其观点仅供科研同行交流,并不是结论性内容,请使用者谨慎使用。

04

附件:

https://www.medrxiv.org/content/10.1101/2020.01.31.20019901v1

信息名称

中国湖北2019-nCoV疫情趋势的建模

01

时间:

2020年2月2日

02

机构或团队:

吉林大学

03

事件概要:

吉林大学院研究人员在medRxiv预印版平台发表论文“Modelling the epidemic trend of the 2019-nCOV outbreak in Hubei Province, China”。

文章指出,截至2020年1月30日(北京时间)凌晨8点,世界各地已确诊约8000例病例。有必要模拟受灾最严重的湖北省2019-nCOV疫情的流行趋势。研究通过SEIR模拟,预计湖北省的流行高峰期将在2020年1月28日至2020年2月7日之间,感染病例将达到7000-9000例。这些估算是基于一些假设,存在一定的局限性。

*注,本文为预印本论文手稿,是未经同行评审的初步报告,其观点仅供科研同行交流,并不是结论性内容,请使用者谨慎使用。

04

附件:

https://www.medrxiv.org/content/10.1101/2020.01.30.20019828v1

信息名称

实时估计2019-nCoV感染导致的死亡风险:基于输出病例的推断

01

时间:

2020年2月2日

02

机构或团队:

北海道大学

03

事件概要:

北海道大学研究人员在medRxiv预印版平台发表论文“Real time estimation of the risk of death from novel coronavirus (2019-nCoV) infection: Inference using exported cases”。

文章指出,在其他国家/地区确诊的2019-nCoV输出感染病例为估计中国的累积发病率和确诊的病例死亡风险(cCFR)提供了机会。对cCFR的了解对于在流行的早期表征严重程度并了解2019-nCoV的大流行潜力至关重要。该研究使用发病率的指数增长率,从统计学上估算了cCFR和基本传染数。截至2020年1月24日,有23个输出病例,估计自2019年12月8日起的增长率(情景1),并使用自输出病例增长以来的数据(情景2),估计中国的累计发病率分别为5433例(95%CI:3883、7160)和17780例(95%CI:9646、28724)。情景1的cCFR最新估计为4.6%(95%CI:3.1-6.6),情景2的cCFR最新估计为7.7%(95%CI:4.9-11.3%)。对于情景1和情景2,基本传染数分别估计为2.2(95%CI:2.1、2.3)和3.7(95%CI:3.1、4.3)。根据结果,研究人员指出当前的2019-nCoV流行有引起大流行的潜力。该方法可用于使用公开数据评估传染病的早期风险。

*注,本文为预印本论文手稿,是未经同行评审的初步报告,其观点仅供科研同行交流,并不是结论性内容,请使用者谨慎使用。

04

附件:

原文链接

https://www.medrxiv.org/content/10.1101/2020.01.29.20019547v1

信息名称

新型冠状病毒2019-nCoV的传播和流行病学特征:与2003-SARS比较的初步证据

01

时间:

2020年2月2日

02

机构或团队:

陕西中医药大学、陕西省疾控中心、山东省妇幼保健院

03

事件概要:

2月2日,medRxiv预印本在线发表了来自陕西中医药大学、陕西省疾控中心等团队的研究。论文通过收集国家卫键委和世界卫生组织网站上的新型冠状病毒肺炎和2003-SARS疫情信息,分析比较这两种传染病的传播动态。从16个省卫健委网站上获得了287例确诊的新型冠状病毒肺炎患者信息。采用描述性流行病学分析方法,对该病的流行特征进行了细致的分析。随后,对武汉市和我国其他内陆地区的新型冠状病毒肺炎疫情资料进行了分析比较。根据确诊的NCIP病例数据,建立了多元函数模型。

结果表明,此次新型冠状病毒肺炎新发病例和死亡病例的增长速度明显快于2003-SARS。武汉等内陆地区确诊病例数均呈上升趋势。287例确诊为新型冠状病毒肺炎患者年龄从9个月~90岁都有,平均(42.38±15.97)岁。性别比男:女为1.35:1。武汉等内陆地区新型冠状病毒肺炎患者数量增长趋势均呈现线性分布,分别为Y=0.7209x3-11.97x2+59.129x(R2=0.9858)和Y=2.2169x3-39.74x2+158.88x(R2=0.9357),从R2值判断拟合效果良好。

文章得出以下结论,新型冠状病毒肺炎死亡率低于2003-SARS,治愈率较高。新型冠状病毒肺炎患者年龄主要集中在30-50岁(68.29%)。第一代新型冠状病毒肺炎患者的传染和危害程度确实高于第二代患者。

*注,本文为预印本论文手稿,是未经同行评审的初步报告,其观点仅供科研同行交流,并不是结论性内容,请使用者谨慎使用。

04

附件:

原文链接

https://www.medrxiv.org/content/10.1101/2020.01.30.20019836v1

信息名称:

普林斯顿大学等研究团队提出一种新的方法体系,用于2019- nCoV早期爆发Ro的初步估计及其不确定性分析

01

时间:

2020年2月2日

02

机构或团队:

美国普林斯顿大学、、乔治亚理工学院和加拿大西安大略大学、麦克马斯特大学

03

事件概要:

2019- nCoV已成为全球威胁,随着其流行发展,许多疾病建模研究者已经优先估计了其基本生殖数Ro。这些工作非常有价值,但已有建模方法和由此产生的估计值差别很大。

2月2日,medRxiv预印本在线发表的一篇来自普林斯顿大学等研究团队的文章中,在此文章中,研究者提出了一个新的方法框架,将Ro分解为三个关键量(指数增长率r、平均世代间隔G和世代间隔分布kappa),以此方法框架来比较之前各种模型中的Ro,并将此方法体系应用于2019-nCoV爆发的Ro早期估计中。该方法强调了所有三个量中传播不确定性的重要性,特别是在生成世代间隔分布时。

文章认为在疫情爆发期间,快速的反应虽然可能很有价值,但要避免过度自信。建模研究人员应与防控现场工作人员合作,开发更好的方法来表征病毒世代间隔。

*注,本文为预印本论文手稿,是未经同行评审的初步报告,其观点仅供科研同行交流,并不是结论性内容,请使用者谨慎使用。

04

附件:

原文链接

https://www.medrxiv.org/content/10.1101/2020.01.30.20019877v1

信息名称

机场筛查在检测2019-nCoV感染旅客中的效果

01

时间:

2020年2月2日

02

机构或团队:

伦敦卫生与热带医学院

03

事件概要:

随着中国和其他国家新型冠状病毒肺炎病例数量的增长,各国公共卫生相关部门需要证据来证明机场入境人员发热筛查等控制措施的效果和有效性。

2月2日,medRxiv预印本在线发表的一篇来自伦敦卫生与热带医学院研究团队的文章中,则评估了针对2019-nCoV感染的出入境筛查的效果和有效率。在他们的基线情景中,研究人员估计,感染旅行者中有46.5%(95% 置信区间:35.9到57.7)将不会被检测到,这取决于是否处于潜伏期、出入境筛查手段的敏感性以及无明显发病症状病例的比例。所以,机场筛查不太可能检测到足够比例的2019-nCoV感染旅客,并避免已感染旅客的入境。

研究团队开发了一个在线工具,以便在获得新信息时能及时更新结果。模型代码可通过GitHub网站获取,其结果可在R Shining APP中进一步开发,网址为https://cmmid-lshtm.shinyapps.io/traveller_screening/。

文中提到的APP应用的截图

*注,本文为预印本论文手稿,是未经同行评审的初步报告,其观点仅供科研同行交流,并不是结论性内容,请使用者谨慎使用。

04

附件:

原文链接

https://www.medrxiv.org/content/10.1101/2020.01.31.20019265v1

信息名称

深度学习算法预测武汉2019新型冠状病毒的宿主及感染性

01

时间:

2020年1月24日

02

机构或团队:

北京大学、浙江大学

03

事件概要:

北京大学和浙江大学的研究人员在bioRxiv预印版平台发表论文“Host and infectivity prediction of Wuhan 2019 novel coronavirus using deep learning algorithm”。

文章基于深度学习算法开发的VHP(病毒宿主预测)方法,用以预测新型病毒潜在宿主,并应用于武汉2019新型冠状病毒检测。研究显示,与感染其他脊椎动物的冠状病毒相比,蝙蝠SARS样冠状病毒与新型冠状病毒具有更相似的感染模式。此外,通过比较所有宿主在脊椎动物上的病毒传染模式,发现水貂病毒的传染性模式更接近新型冠状病毒。感染性模式分析的结果表明,蝙蝠和水貂可能是新型冠状病毒的两个潜在宿主。

*注,本文为预印本论文手稿,是未经同行评审的初步报告,其观点仅供科研同行交流,并不是结论性内容,请使用者谨慎使用。

04

附件:

原文链接:

https://doi.org/10.1101/2020.01.21.914044

信息名称

重组ACE2-Ig有效中和2019株新型冠状病毒

01

时间:

2020年2月2日

02

机构或团队:

第二军医大学、上海交通大学医学院、Pharchoice Therapeutics Inc

03

事件概要:

bioRxiv预印版平台于2月2日发表论文“Potent neutralization of 2019 novel coronavirus by recombinant ACE2-Ig”,指出,重组ACE2-Ig可有效中和2019株新型冠状病毒。

研究人员通过将人ACE2的胞外结构域连接到人免疫球蛋白IgG1的Fc区域产生一种新的重组蛋白;同时使用一个低催化活性的ACE2突变体,并对融合蛋白进行鉴定。两种融合蛋白均与SARS-CoV和2019-nCoV的受体结合域(RBD)具有高亲和力结合,并具有理想的药理特性。此外,融合蛋白在体外能有效中和SARS-CoV和2019-nCoV。研究表明,由于这些融合蛋白对冠状病毒表现出交叉反应性,可能对2019-nCoV的诊断、预防和治疗具有潜在的应用价值。

*注,本文为预印本论文手稿,是未经同行评审的初步报告,其观点仅供科研同行交流,并不是结论性内容,请使用者谨慎使用。

04

附件:

原文链接:

https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2020.02.01.929976v1

信息名称

韩国Deargen公司等机构发文建议考虑使用MT-DTI模型确定的抗病毒药物清单

01

时间:

2020年2月2日

02

机构或团队:

韩国Deargen公司、美国艾莫利大学、檀国大学等

03

事件概要:

韩国Deargen公司、美国艾莫利大学、檀国大学等研究人员在bioRxiv预印版平台发表论文“Predicting commercially available antiviral drugs that may act ”

研究人员使用经过预先训练的基于深度学习的药物-靶标相互作用模型,称为分子转换-药物靶标相互作用(MT-DTI),以识别可以作用于2019-nCoV病毒蛋白的市售药物。结果表明,用于治疗和预防人类免疫缺陷病毒(HIV)的抗逆转录病毒药物阿扎那韦是最好的化合物,对2019-nCoV 3C样蛋白酶的Kd抑制作用为94.94 nM,其次是依非韦伦(199.17 nM),利托那韦(204.05 nM)和度鲁特韦(336.91 nM)。洛必那韦、利托那韦和达鲁纳韦都是靶向病毒蛋白酶,然而,在作者的预测中,它们也可能以Kd <1000 nM的抑制力与2019-nCoV的复制复合物成分结合。此外,还发现,尽管没有现实证据支持该预测,但几种抗病毒药物(例如克力芝)可用于治疗2019-nCoV。建议在建立2019-nCoV的有效治疗策略时应考虑MT-DTI模型确定的抗病毒药物清单。

*注,本文为预印本论文手稿,是未经同行评审的初步报告,其观点仅供科研同行交流,并不是结论性内容,请使用者谨慎使用。

04

附件:

原文链接:

https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2020.01.31.929547v1

信息名称

基因组检测冠状病毒类型工具,用于快速鉴定和表征新型冠状病毒基因组

01

时间:

2020年2月2日

02

机构或团队:

南非夸祖鲁-纳塔尔大学健康科学学院检验医学与医学科学学院,夸祖鲁-纳塔尔研究创新和测序平台;巴西米纳斯吉拉斯州联邦大学生物科学研究所细胞和分子遗传学实验室;南非艾滋病研究计划中心;华盛顿大学全球卫生系等

03

事件概要:

研究人员在bioRxiv预印版平台发表论文“Genome Detective Coronavirus Typing Tool for rapid identification and characterization of novel coronavirus genomes”。

研究指出,基因组检测(Genome Detective)是一个基于Web的用户友好型软件应用程序,可以快速,准确地从下一代测序数据集中组装所有已知的病毒基因组。此应用程序允许以FASTA格式从组装的基因组中鉴定系统发生簇和基因型。自2019年发布以来,已经为导致大规模爆发的新兴病毒进行检测,如巴西的寨卡病毒(Zika)和黄热病毒(Yellow fever virus)。该研究介绍了基因组探测冠状病毒分型工具,该工具可以准确识别在中国和世界各地分离的新型冠状病毒(2019-nCoV)序列。该工具每次提交最多可以接受2000个序列,对新的完整基因组序列的分析大约需要一分钟。该工具已对十个冠状病毒物种的数百个全基因组进行了测试和验证,并正确分类了所有与SARS相关的冠状病毒(SARSr-CoV)和所有可用于2019-nCoV的公共数据。随着疫情在全球范围内的扩展,该工具还可以跟踪新的病毒突变,这可能有助于加速新型诊断方法,药物和疫苗的开发。

*注,本文为预印本论文手稿,是未经同行评审的初步报告,其观点仅供科研同行交流,并不是结论性内容,请使用者谨慎使用。

04

附件:

原文链接:

https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2020.01.31.928796v1.full.pdf

信息名称

从基因组测序数据中检测新的人类病毒

01

时间:

2020年2月1日

02

机构或团队:

德国柏林罗伯特·科赫研究所、柏林自由大学、德国哈索-普拉特纳数字工程研究院等

03

事件概要:

德国柏林罗伯特·科赫研究所、柏林自由大学、德国哈索-普拉特纳数字工程研究院研究人员在bioRxiv预印版平台发表论文“Interpretable detection of novel human viruses from genome sequencing data”。

文章指出,病毒进化极其迅速,可靠的病毒宿主预测方法是保障生物安全的必要手段。用标准的生物信息学工作流程很难检测出新型的人感染病毒。文章中研究人员尝试使用下一代测序技术来预测病毒是否会直接感染人类。

研究人员提出了一种基于单个DNA读码或读码对预测新病毒宿主的新方法。结果表明,深度神经结构明显优于浅层的机器学习和标准的、基于同质性的算法,将错误率降低了一半,并将与训练过程中给出的分类单元进行泛化。研究人员使用新的卷积滤波可视化方法,用于提取每个核苷酸在最终分类决策中的信息内容。病原体基因组和感染表型之间的已知关联的核苷酸解析图可用于检测新病原体中与病毒相关的基因。

*注,本文为预印本论文手稿,是未经同行评审的初步报告,其观点仅供科研同行交流,并不是结论性内容,请使用者谨慎使用。

04

附件:

原文链接:

https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2020.01.29.925354v2

信息名称

新型冠状病毒2019(2019 nCoV)利用SARS冠状病毒受体ACE2和细胞蛋白酶TMPRS2进入靶细胞

01

时间:

2020年1月31日

02

机构或团队:

德国莱布尼茨灵长类研究所、德国哥廷根大学、汉诺威兽医大学等

03

事件概要:

德国莱布尼茨灵长类研究所等机构研究人员在bioRxiv预印版平台发表论文“The novel coronavirus 2019 (2019-nCoV) uses the SARS-coronavirus receptor ACE2 and the cellular protease TMPRSS2 for entry into target cells”。

一种新型高致病性冠状病毒2019-nCoV在中国的出现及其在国内外的迅速传播,构成了全球卫生紧急事件。冠状病毒利用它们的尖刺蛋白(spike protein)来选择和进入靶细胞,因此,深入了解nCoV-2019尖刺蛋驱动的进入,有助于评估大流行的可能性并揭示治疗靶点。研究人员发现2019-nCoV-S使用SARS冠状病毒受体ACE2进入靶细胞,借助细胞蛋白酶TMPRSS2启动。TMPRSS2抑制剂可以阻止进入病毒的进入,这可以成新的治疗方案。研究人员还发现恢复期SARS患者的血清可以中和2019-nCoV-S驱动的进入。2019-nCoV与SARS冠状病毒的感染共性,揭示了二者相似的传播性和疾病发病机制。研究人员还确定了抗病毒干预的靶点。

*注,本文为预印本论文手稿,是未经同行评审的初步报告,其观点仅供科研同行交流,并不是结论性内容,请使用者谨慎使用。

04

附件:

原文链接:https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2020.01.31.929042v1

信息名称

美国免疫与呼吸道疾病中心等机构发文揭示美国首例新冠病毒肺炎的治疗过程

01

时间:

2020年1月31日

02

机构或团队:

美国免疫与呼吸道疾病中心、美国疾病预防控制中心、华盛顿大学医学院等

03

事件概要:

《新英格兰医学杂志》(NEJM)在短篇报告栏目(Brief Report)报道了美国首例确诊新型冠状病毒肺炎患者成功治愈的病例。文章描述了美国第一例2019-nCoV感染的流行病学和临床特征。

文章指出,该患者发病第4日采集的初始呼吸道样本(鼻咽拭子和口咽拭子)呈2019-nCoV阳性。疾病第4日的循环阈值(Ct)低(鼻咽样本为18~20,口咽样本为21~22),因此提示尽管患者的初始症状轻,但这些样本中的病毒载量高。发病第7日采集的两份上呼吸道样本仍呈2019-NcV阳性,并且鼻咽拭子样本的病毒载量仍然高(Ct值,23~24)。发病第7日采集的粪便样本也呈2019-NcV阳性(Ct值,36~38)。两个采样日期采集的血清样本均呈2019-nCoV阴性。发病第11日和第12日采集的鼻咽和口咽样本显示出病毒载量下降趋势。发病第12日采集的口咽样本呈2019-nCoV阴性。研究人员仍在等待上述日期采集的血清样本rRT-PCR结果。

口咽和鼻咽样本全基因组序列完全相同,并且与已发布的其他2019-nCoV序列几乎相同。在该患者的病毒和2019-nCoV参考序列(NC_045512.2)之间,只有位于开放阅读框8的3个核苷酸和1个氨基酸存在差异。该序列参见GenBank(登录号MN985325)。

04

附件:

原文链接:https://www.nejm.org/doi/full/10.1056/NEJMoa2001191

信息名称

哥伦比亚大学研究人员发现核苷酸类似物或可作为病毒聚合酶的抑制剂

01

时间:

2020年1月31日

02

机构或团队:

哥伦比亚大学

03

事件概要:

哥伦比亚大学研究人员在bioRxiv预印版平台发表论文“Nucleotide Analogues as Inhibitors of Viral Polymerases”。

研究人员基于其对丙型肝炎病毒和冠状病毒使用类似病毒基因组复制机制的分子认识,推断美国食品药品管理局(FDA)批准的治疗丙型肝炎的药物EPCLUSA(Sofosbuvir/Velpatasvir)也将抑制SARS、MERS等冠状病毒,包括2019-nCoV。为了开发广谱抗病毒药物,研究人员进一步描述了一种设计和合成病毒聚合酶抑制剂的新策略,方法是将开发Sofosbuvir时使用的ProTide前药技术与其之前构建到具有聚合酶终止功能的核苷酸类似物中的3’-阻断基团相结合

04

附件:

https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2020.01.30.927574v1

信息名称

热那亚大学等机构研究人员发文分析2019‐nCoV疫情全球传播情况

01

时间:

2020年1月31日

02

机构或团队:

热那亚大学、圣马蒂诺医院传染病诊所

03

事件概要:

European Journal of Clinical Investigation期刊发表论文“The Novel Chinese Coronavirus (2019‐nCoV) Infections: challenges for fighting the storm”。

文章指出,自2019年12月底以来,中国湖北省武汉市报告了一群不明原因肺炎患者。他们与武汉华南海鲜市场有共同的联系,现在已经证实这种疾病是由一种新型冠状病毒(暂定为2019‐nCoV)引起的。截至2020年1月30日,中国已确诊7734例, 台湾、泰国、越南、马来西亚、尼泊尔、斯里兰卡、柬埔寨、日本、新加坡、韩国、阿联酋、美国、菲律宾、印度、澳大利亚、加拿大、芬兰、法国和德国等已累计报告90例。据公布的消息,病死率为2.2%(170/7824)。

04

附件:

https://onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1111/eci.13209

信息名称

复旦大学等机构研究人员联合发表评论文章呼吁制定治疗和预防策略

01

时间:

2020年1月31日

02

机构或团队:

复旦大学、纽约血液中心、中国科学院武汉病毒研究所

03

事件概要:

复旦大学、纽约血液中心、中国科学院武汉病毒研究所研究人员在Emerging Microbes & Infections期刊联合发布评论文章“An emerging coronavirus causing pneumonia outbreak in Wuhan, China: calling for developing therapeutic and prophylactic strategies”。

文章指出,近年来开发的SARS-CoV、MERS-CoV中和单克隆抗体(mAbs)和具有保护作用的纳米体主要针对S蛋白的S1亚基,尤其是RBD。因此,2019-nCoV S-RBD有望成为开发2019-nCoV中和单克隆抗体的关键目标。针对非RBD区域的中和单克隆抗体,包括SARS-CoV和/或MERS-CoV S的NTD和S2也可以被识别,尽管它们的中和效能一般低于特定于RBD的单克隆抗体。研究和开发针对2019-nCoV感染的中和抗体可能需要几个月甚至几年的时间。一种快速的方法是评估现有的具有交叉中和和保护活性的SARS-CoV中和抗体,以对抗2019-nCoV感染。研究人员已经证明,SARS-CoV S-RBD-特异性中和单克隆抗体和血清可以交叉中和bat-SL-CoVs,如bat-SL-CoV-W1V1和bat-SL-CoV-SHC014,提示它们也可能交叉中和2019-nCoV。一旦被发现,这些交叉中和抗体可以被迅速开发,用于2019-nCoV感染的紧急预防和治疗。

04

附件:

原文链接

https://www.tandfonline.com/doi/full/10.1080/22221751.2020.1723441

信息名称

Nature新闻报道世界各地实验室争相分析新型冠状病毒活性样品

01

时间:

2020年1月31日

02

机构或团队:

Nature杂志

03

事件概要:

Nature 1月31消息称,目前世界各地病毒学家都渴望获得新型冠状病毒的物理样本,以测试药物和疫苗,开发感染的动物模型并调查有关病毒生物学的问题,例如病毒的传播方式。

第一个分离和研究该病毒的实验室是武汉病毒研究所,该团队从一名49岁女性中分离出了该病毒,发现该病毒可以杀死培养的人细胞,并且它通过与另一种冠状病毒SARS相同的分子受体进入细胞。美国国家过敏和传染病研究所的病毒学家Vincent Munster说,他的实验室有望在下周从美国疾病控制与预防中心获得样本。1月28日,澳大利亚的一家实验室宣布,已经从输入病例那里获得了病毒样本,并准备分享这些样品。荷兰鹿特丹伊拉斯姆斯医学中心的病毒学家Bart Haagmans说,法国、德国和香港的实验室也在分离并准备分享从当地患者那里获得的病毒样本。他透露大概下周他的实验室将得到分离株。

现在已经有几十个从不同患者中提取的病毒的基因组序列,这对该病毒的诊断测试以及研究病原体传播和进化是十分有用的。但是科学家说,序列不能替代病毒样品,而病毒样品是测试药物和疫苗以及深入研究病毒所必需的。1月29日,WHO的传染病流行病学家Maria Van Kerkhove说,“共享病毒至关重要”。

Munster说,他的实验室的首要任务是识别可以以人类相似的方式感染的动物。这种动物模型将对测试疫苗和药物有用。该研究小组首先计划研究一种经过基因工程改造的小鼠,该小鼠含有人类SARS病毒和新型冠状病毒用来感染细胞的受体。他补充说,未来的工作可能包括将小鼠以及后来的非人类灵长类动物暴露于该病毒中,并测试疫苗是否可以预防感染。Munster的实验室也开始抓紧衡量该病毒在空气或唾液中的存活时间。这可以帮助流行病学家了解该病毒是可以通过空气传播还是仅通过紧密接触传播。Munster的研究将涉及使用称为Goldberg鼓的容器将病毒颗粒雾化,然后释放到空气中一段时间后测量其感染人类细胞的能力。该实验将在严密的措施生物安全3级实验室,以防止实验室工作人员受到感染并避免病原体的意外释放。

Haagmans团队的首要任务是开发一种针对该病毒的抗体的血液测试。这将使研究人员能够识别已暴露于2019-nCoV的人,但是没有被感染并且可能从未出现症状。他的团队还希望研究动物雪貂是否可以作为人类感染的模型。研究人员将这些动物用于研究流感和其他呼吸道疾病,因为它们的肺部生理学与人类相似,并且容易感染某些相同的病毒。Haagmans希望测试是否可以在它们之间传播病毒,以寻求对病原体在人与人之间传播的了解。尽管目前Haagmans迫切地想要获得一个病毒样本,但他希望最终在暴发过程中获得多个样本,以查看病毒是否以及如何进化。病毒学家就2019-nCoV提出的许多问题都基于先前对SARS和MERS相关的病毒的研究。

04

附件:

新闻链接:https://www.nature.com/articles/d41586-020-00262-7

免责申明

“‘2019-nCov’科研动态信息分类汇编”由中国科学院武汉文献情报中心和中国科学院文献情报中心合作推出。该项服务旨在通过提供最新科研论文线索、摘译科研论文主要内容,为我国的科研攻关和相关科学研究提供参考。工作团队保持中立立场,无倾向性意见,所摘译内容主要用于说明科研论文本身,努力客观真实反映原文情况,起到供使用者参考的目的。所摘编内容都有具体的文献来源,请使用者通过文献来源线索获取具体的原始文献,并自行甄别和使用。由于水平所限,所摘编内容不免会有疏漏,还请各位使用者谅解。

点击“阅读原文”获取《"2019-nCov"科研动态信息汇编》全文, 提取码: ectx

或通过下方小程序码快速获取全文:

中国科学院文献情报中心立足中国科学院、面向全国,主要为自然科学、前沿交叉科学和高技术领域的科技自主创新提供文献信息保障、战略情报研究服务、公共信息服务平台支撑和科学交流与传播服务,同时通过国家科技文献平台和开展共建共享为国家创新体系其他领域的科研机构提供信息服务。

转载授权、合作、投稿事宜请在本文留言

中国科讯App

随时随地查阅文献,体验更多学术功能