海潮庵原名水潮庵，因与地处庵山顶的云峰庵同为崇武最早的佛教庵堂，又被民间称为下庵。处于崇武城的水关内，距关门10余米。此地正处莲花峰西南麓、紧临崇武港内港池，建成前涨潮时海水直至庵前。东南及东北侧山坡，乃崇武较早的居住区，境称海潮保，又称乐善保，在此有观潮之乐。今出水关跨环城大道即为崇武文化广场，其北为海景湾花园商住区，其南为中华石雕工艺博览园入口处，是为来崇武的游客必到之处。
庵堂坐北朝南，占地面积1200平方米。旧庵堂建筑面积约300平方米，主体为三开间、木构架、两面坡硬山式大厅，左前列廊庑，中隔一横廊（古为拜亭）把天井分为上下层，前为大门。大门外有广场，右侧有空地于1936年詹式建贞节堂。2001年10月30日奠基开始重建。主体建筑包括大雄宝殿（325平方米）、天王殿、东西廊、钟鼓楼，附设法堂、藏经阁、义诊所、经书流通处。新寺宇规制大大超越旧庵，建成后将成为崇武城里最雄伟的佛教活动场所。
《崇武所城志》载，“旧传未建城时先有此庵”。建成后“军民杂处，附建各事，共集此庵。”“嘉靖甲子岁（1564），乡众重建。万历元年（1573）九月初一日，淫雨异常，水涨满城堞，庵淹不废”。此后，“天启六年丙寅（1626），经公洪源割庵西产地二尺以广之，募众重新。前廊安置龙舟，天井增一拜亭。”后来清军水师欲攻打厦门时，把庵拆毁，仅存大堂，至同治年间（1862-1874）再次募众重修。
到了清末民国初，庵的敬祀活动全面停止，佛像等也不存在，只有西侧后起的贞节堂居住斋故念佛。1934年在此设莲城小学。1939年改设为镇公所。1950年开始又一直作为学校的校舍使用。1986年旧庵全被拆除，改建为新校舍，仅留贞节堂并在堂前增建楼房两间，与贞节堂连成一体，又建山门署名海潮庵。该庵从兴盛至衰落又再次复兴，反映了崇武人对佛教信仰观念的变化。
庵主祀三世尊佛，即释迦如来、药师如来和弥陀如来。主要宗教活动为四月初八日佛诞日及十二月初八日佛成道日。同祀观音菩萨，其活动则有二月十九日、六月十九日、九月十九日的观音菩萨圣诞。届时尼众及斋友齐集佛堂，奉香敬果，诵经念佛，并开设素宴。
1961年，开持尼师（原名甘竹修，崇武潮乐村人）自泉州大本堂回崇武，进海潮庵当主持。她能讲经说道，还自学骨伤科及外科，救死扶伤、济贫渡众，深得民众钦佩。她还广育僧才，先后送众徒进闽南佛学院、福州正心寺等地深造。在开持尼师推动下，海潮庵与各地佛教组织广泛交往。世界和东南亚佛教会会长菲律宾瑞今和尚、新加坡佛教会长妙灯法师、台湾佛教护德协会会长释传孝等高僧大德曾来庵弘法。