目前主要在新加坡传播的病毒种类不是原有的德尔塔变种毒株，而是两种德尔塔的亚型变异株。受访专家指出，目前没有证据显示亚型变异株的传播力比原有的德尔塔毒株高，也不意味着疫苗会失效。
冠病毒株的变种问题一直受到关注，虽然新加坡暂时没有出现“奥密克戎”（Omicron）变种毒株，但今年下半年肆虐全球的德尔塔毒株也没有“闲着”，而是悄悄发生了亚变异。
根据全球共享流感数据倡议组织（GISAID）的数据和瑞士CoV-Spectrum网站分析，德尔塔今年6月占新加坡上传的病毒基因排序超过八成，但在6月底和7月初骤降，取而代之的是7月中旬占超过99％的德尔塔AY.23亚型变异株。
之后，德尔塔的另一种亚型变异株——AY.23.1在8月中旬出现并上涨至当地上报数量的六成，AY.23反而退居第二。
新加坡积极监测通报
截至11月13日，新加坡之前14天所上传的基因排序中，55.8％是AY.23.1亚型、41.7％是AY.23亚型，其余排序也都是属于德尔塔病毒的亚型变异株。新加坡一向积极通报，这两种亚型基因数量分别占了全球上传量的97％和32％。
新加坡科技研究局生物资讯研究院副院长（研究）莫勒—斯特罗（Sebastian Maurer-Stroh）受访时指出，原有的德尔塔毒株和两种亚型变异株的不同之处，在于细微的基因变化。
他解释，病毒自然会产生变化，细微变化也可用以标记不同毒株的组别和世系。
他说：“这些世系的差别纯粹在于他们的基因构造，并不是说一定要改变病毒传播力才会形成新世系。进行大量基因组监测的国家都会发现一些新的世系，目前没有证据和表象显示，AY.23.1的传播力有任何改变。”
印度印尼更早发现AY.23.1
针对有一些网站将AY.23.1列为“新加坡毒株”，莫勒—斯特罗指出，GISAID的数据显示全球另六个国家早前也发现这种亚型变异病毒株，其中包括印度和印尼，亚型变异病毒株之后才在新加坡出现，因此称之为“新加坡毒株”并不准确。
国家传染病中心的国家公共卫生实验室主任林择彬副教授也解释，由于新加坡完成的基因排序比本区域其他国家多，也导致亚型变异株看起来多来自新加坡。
亚型变异株的出现是否会影响疫苗的效能？
林择彬副教授说：“目前这些变异株的病毒刺突蛋白质并没有改变，抗体会附着在病毒刺突蛋白质上消灭病毒，因此没有迹象显示疫苗的效能会受到影响。”