鉴于新加坡近来社区病例激增，教育部制定额外防疫措施，将为小学和特需学校采取额外防疫措施，以更好地保护还无法接种冠病疫苗的孩童。
按照考试安排，今年9月30日至10月6日期间举行小六会考。
居家学习
与2020年年终国考安排类似，小六学生将于2021年9月25日至29日在小六会前进行休学，以尽量减少校内传播的风险，减少人数在考试前被隔离(QO)或请假(LOA)的学生。
考虑到近日不能接种疫苗的学生受到疫情影响激增，教育部还提出新的安排，在今年小六会考期间，为所有小一至小五学生实施居家学习（HBL），即从2021年9月27日至小六结束（2021年10月6日）。
居家学习期间，小学和特需学校将继续为需要额外帮助的学生提供帮助。
教育部幼儿园、幼儿园托管服务（KCare）和学生托管中心将如常运作。家长若无法在家办公或做出其他托管安排，可向孩子的学校寻求协助。
返校前自测
教育部也鼓励小学生在在以下日期在家中自行做抗原快速检测（ART）。这将提供足够的时间间隔，如有必要，让学生进一步接受聚合酶链式反应（PCR）检测。
小六：2021年9月27日或28日
小一至小五：2021年10月4日或5日
到了下周一（9月20日），本地约九成的家庭应该都会收到抗原快速检测仪，学校也在派发检测仪给学生与教职员，让人们在家自行检测。
卫生部医药服务总监麦锡威副教授说，民众如果在无症状的情况下，自行检测后发现结果呈阳，应该在家里隔离至少72小时，然后再做一次检测，确保呈阴后才恢复日常活动。
考场措施
对所有考生进行体温测量和检查。
在考试期间始终佩戴外科口罩或具有同等效果的可重复使用的口罩。
对于在学校礼堂进行的考试，将进行区域划分，每个区域最多有50名考生，每个场地最多有250名考生。各区之间至少要有3米的间隔。在每个区域内，考生的座位相距至少1.5米。
对于在教室进行的考试，每间教室最多有30名考生，他们的座位相距至少1.5米。
错开考生离开的时间，以及隔离进入和离开的路线，以尽量减少考生的混杂，避免拥挤。
小六会考改革
小六会考今年改以“八级”的积分等级来评估学生自身学习表现，不再采用与同届考生相比较后计算的T值积分。各科等级积分加起来的总成绩，类似Ｏ水准会考升学使用的积分计算法。
小六考生每科的积分等级介于AL1至AL8，AL1为最优秀的。学生在小六会考四科总成绩因此会介于4分至32分。
新加坡教育部指出，新制度不对成绩做过于细致的区分，较多学校会有相同的截分点，学生能有更广的选择。
整体而言，各中学的截分点介于6分至30分，没有学校出现4分的截分点。但教育部认为基于积分制的设计等原因，接下来不太可能有学校出现4分的截分点，每届截分点的波动一般仅有一分之差。
N水准听力考试问题
9月13日，参与N水准英语听力考试的学生对于低沉的配乐和强烈的口音表示不满。
超过1,400人在Change.org请愿网站上签署了一份请愿书，要求重新进行考试。
新加坡考试与评估委员会(SEAB)表示，已收到反馈，但是并没有重新安排考试的计划。
SEAB指出，广播音频可能受到“环境因素的影响，如下雨、道路施工和转动风扇”，因为作为安全管理措施的一部分，学校被建议保持教室窗户打开和风扇开启。
对于口音的问题，SEAB表示，今年考试的文本阅读者是新加坡人，他们讲的是国际上可接受的英语，并且在过去几年的国考中都有过表现。
“将使用不同的语音质量，如节奏、音量和语调，以确保音频文本的真实性。
“此外，各个国家听力理解考试的音频文本中使用的单词对于考生的预期水平来说是可以理解的。”