新加坡过去四周上传至全球流感共享数据库的病毒基因组序列中,有超过91%是B1617系的变种毒株,比率为全球第二高。受访专家认为,这显示本地近日相对大规模的本土病毒传播,主要通过几起境外输入病例引发,这项数据有助于公共卫生机构更好地应对病毒传播。
根据全球流感共享数据库(Global Initiative on Sharing All Influenza Data, 简称GISAID)的数据,新加坡至今一共上传292组B1617系的变种病毒基因组序列。其中,在过去四周就上传了51组B1617系毒株的基因组序列,占本地同一时期内上传所有基因组序列的91%,仅次于伊朗的100%。在数量方面,新加坡上传的B1617系毒株基因组序列,则排全球第五。
除了B1617系,新加坡也一共上传182组B117系变种毒株,其中一组在过去四周内上传。B1351系病毒株方面则共有75组,其中三组是过去四周内上传。另外,新加坡也一共上传六组P1、四组B1427和B1429,以及五组B1525变种毒株,我国过去四周没有上传属于这三种病毒株的新序列。
亚太临床微生物学与传染病学学会会长淡马亚教授受访时说:“新加坡上传的病毒基因组序列显示,这里过去四周的情况与英国和澳大利亚相似,也就是病毒从少数途径传入本地并出现较多的本土传播。这跟美国和德国有较多的输入型病毒不同,这样的数据有助公共卫生部门制定更合适的应对措施。”
新加坡国立大学苏瑞福公共卫生学院副院长(研究)古阿烈副教授则指出,由于每个国家上传的数据完整性不同,对比实际上传序列数量的意义不大。不过,每个国家上传的基因组序列中不同变种毒株的比率,倒是具有参考价值。
受访专家认为,这显示本地近日相对大规模的本土病毒传播,主要通过几起境外输入病例引发,这项数据有助于公共卫生机构更好地应对病毒传播。(海峡时报档案照)
毒株基因组序列比率反映各国冠病疫情演变
“数据显示英国和印度的德尔塔(Delta,即B16172毒株)变种毒株的占比相似,而新加坡上传的德尔塔变种毒株比率则是全球第二,显示这个变种毒株已经取代了本地之前看到的毒株,也反映出它的传播力更强。”
淡马亚教授也指出,毒株基因组序列的比率也能更好地反映各国冠病疫情演变的性质。其中,过去几周英国上传B117变种毒株的基因组序列比率不断减少,B1617毒株基因组序列比率则正在增加。
全球流感共享数据库目前是全球最大的病原基因资料数据库,是在全球暴发禽流感后于2008年成立,至今已经累积超过187万组冠病毒株的基因组序列。新加坡科技研究局(A*STAR)及旗下生物资讯研究院是数据库重要合作方之一。
淡马亚说:“全球流感共享数据库的数据由各国受认证的合格实验室上传,让研究人员共享资料,任何虚假的数据也能被用户快速辨识出来并提出质疑。与其他数据一样,富裕国家有更多资源完成更多排序并上传更多资料。不过,数据库也意识到这一点,并已为中低收入国家的科学家提供培训。”
记者:王康威 刘智澎