奥密克戎新亚变异株的流行率正在增加,但目前尚不清楚它是否会导致感染或住院人数大幅增加。
对驱动程序进行 COVID-19 测试。
新的一年,新的变体。正当科学家们开始掌握全球流行的SARS-CoV-2变种的字母汤——你的BQ.1.1、CH.1.1和BF.7——由于一种特殊的新突变,一个谱系似乎正在上升到顶峰。
根据佐治亚州亚特兰大的美国疾病控制和预防中心 (CDC) 的预测,XBB.1.5 亚变异现在约占美国 COVID-19 病例的 28%,其患病率在全球范围内呈上升趋势。在美国东北部,它似乎已经迅速超越了预计今年冬天将相互传播的其他免疫躲避变种的动物园。
“它几乎肯定会在世界上占据主导地位。我现在找不到一个竞争对手。其他一切都是无与伦比的,“北京大学免疫学家曹云龙说,他的团队正在实验室中研究XBB.1.5的特性。
科学家警告说,XBB.1.5在美国及其他地区的影响还远未明朗。该变种可能不会在许多国家引起感染或住院人数的大幅增加,这要归功于接触早期COVID-19浪潮和疫苗接种所建立的高免疫力,特别是最近为重症风险最高的个体提供的加强剂。
然而,研究人员说,即使XBB.1.5不会引起大的COVID-19浪潮,密切跟踪谱系也很重要。该亚变异带有一种罕见的突变,可能会增强其感染性,并为进一步的进化收益创造机会。
奥密克戎的曾孙
顾名思义,XBB.1.5 是一种名为 XBB 的 SARS-CoV-2 变种的分支。该谱系是 BA.2 谱系的两个后代的重组,于 2022 年初开始飙升;BA.2本身是奥密克戎的一个分支。XBB的刺突蛋白具有一系列突变,可增强变体逃避抗体的能力。这帮助XBB在过去几个月变得普遍,特别是在亚洲,它导致新加坡的病例激增。
变体观察者在 2022 年底注意到 XBB.1.5,这要归功于刺突蛋白中罕见的氨基酸变化,称为 F486P。Cao实验室的实验表明,该突变提高了该变体附着在人类ACE2受体上的能力,SARS-CoV-2使用该受体侵入细胞。1.重要的是,这种突变似乎并没有削弱XBB躲避抗体的能力。结果于1月5日发布到bioRxiv预印本服务器,尚未经过同行评审。“XBB在ACE2绑定方面真的很糟糕,”Cao说,XBB.1.5中存在的F486P变化有助于克服这一缺点。
变体附着在ACE2上的能力与其传播性之间的关系并不完全清楚,华盛顿州西雅图弗雷德哈钦森癌症中心的进化病毒学家Jesse Bloom说。但对于XBB.1.5,“F486P似乎给了它另一个推动力,这使得病毒得以传播”,他说。
资料来源:美国疾病控制和预防中心
CDC估计,XBB.1.5是美国第二常见的变异株,占全国病例的28%,在东北部占70%以上(参见'新年,新变种')。海德堡德国癌症研究中心的计算生物学家莫里茨·格斯通(Moritz Gerstung)估计,在美国,该变种的病例大约每周翻一番,而在出现该变种的其他国家则慢一些。这与 2022 年 9 月 BQ.1 和 BQ.1.1 变体的增长速度相当,但比之前的奥密克戎浪潮要慢。“XBB.1.5的传播速度仍然非常快,”Gerstung说。
目前尚不清楚这种增长是否会持续下去,或者这种变种是否会显着增加感染,Gerstung补充道。BQ.1和BQ.1.1看起来将掀起相当大的波浪,但在欧洲和北美却失去了动力。如果XBB.1.5发生同样的事情,那么该谱系可能会悄无声息地取代某些国家/地区的其他变体,而不会导致病例大幅增加。
大城市变体
纽约布法罗大学的生物化学家詹妮弗·苏蒂斯(Jennifer Surtees)想知道研究人员是否高估了XBB.1.5在美国东北部的增长。这种变体在她的团队处理的纽约西部序列中变得越来越普遍,但她还没有注意到纽约市实验室正在记录的XBB.1.5基因组的迅速增长。
Surtees补充说,由于COVID-19测试的下降,衡量XBB.1.5的影响可能并不简单。“我认为我们现在真的是盲目飞行。我们不知道有多少病例真的在那里。
南非斯泰伦博斯大学的生物信息学家Tulio de Oliveira认为,研究人员应该研究医院病例和其他疾病严重程度的指标,以最好地衡量XBB.1.5的影响。他说,美国东北部的寒流和假日聚会等因素可以部分解释该变种的明显激增。“我认为许多科学家很早就得出结论和预测,而且数据很少。
规避专家
研究人员可以同意的一件事是,XBB.1.5与其前身XBB一样,是免疫逃避的大师。它携带许多尖峰突变,削弱了疫苗接种和感染产生的抗体的效力,包括早期的奥密克戎毒株。二价疫苗在实验室测试中提高了能够阻断XBB感染(可能还有XBB.1.5)的抗体水平2,3,但不是很多,曹指出。
在整个 2022 年,包括曹在内的研究人员观察了奥密克戎谱系在病毒刺突蛋白中拾取了一系列逃避抗体的突变,这些突变使新谱系能够克服从疫苗和前一波中获得的免疫力。由于添加了F486P突变,XBB.1.5比其他循环变体更具传播性,因此目前谱系几乎没有进一步改变的进化压力,Cao说。
但随着对亚变种的全球免疫力增强,XBB.1.5不会停滞不前,他说。“我们将看到许多我们以前从未见过的新突变。
自然 613, 222-223 (2023)