深圳在著名大学和顶级研究机构上差距大，在科技领军企业上形成了一定的优势：
近年来，与香港、新加坡、西雅图的等世界先进城市比较，深圳科技创新能力突飞猛进，超过香港，但仍低于新加坡、西雅图。
科技创新是城市经济发展的内生动力，对一个城市经济持续向好发展具有至关重要的作用。深圳、香港、新加坡、西雅图四个城市在不同层面上都体现出较强的科技创新能力，但深圳在著名大学和顶级研究机构上差距大。
香港具有香港科技大学等6所世界著名大学，基础研究能力强。
新加坡有新加坡国立大学等2所世界著名大学，有生物医药、信息、制造等多个领域的先进研究院所，基础研究及基础应用研究能力强，科技产业化水平高。
西雅图有华盛顿大学等多个世界著名大学，有华盛顿技术中心等多个高端研究院所，有微软等世界顶级科技公司，科技基础研究、基础应用研究及其产业化能力都很强；深圳有国家级科技企业约5500家，科技应用研究及其产业化能力强。但四个城市在科技研发投入、科技人才数量、科技领军企业等方面还存在较大差异。
四市科技创新能力对比
通过表示，我们发现在基础研究及基础应用研究上，深圳没有著名的大学与科研院所，层次明显落后于其它三个城市。在科技领军企业代表上深圳形成了一定的优势，与新加坡、西雅图差距在缩小，明显强于香港。
深圳在全社会研发投入上仍显不足，深圳因去年华为407亿人民币的研发投入，领先其它三个城市。但若去掉华为公司的数据后深圳的研发投入将大幅下降，仅为GDP1.47%，比国家科技部统计的2014年2.1%平均水平还低0.63%，显示深圳在研发投入上与先进城市还有差距。
深圳顶尖人才数量与新加坡、西雅图还有显著差距，西雅图、新加坡高端科技人才分别打到35万人和29.5万人。
四城市科技创新比较结论：
从综合创新要素比较看，深圳的科技创新能力高于香港，而远低于新加坡和西雅图，尤其是世界著名大学、一流研发机构、顶级科技企业、高端科技人才差距巨大，这些重要的科技要素决定着科技创新能力的根本提升，需要深圳着眼长远、科学谋划、扎实积累，无法在短期内一蹴而就。