马来西亚地处东南亚（北纬1-7度，东经97-120度），属东8时区，与北京无时差，无夏令时。
国土由马来半岛南部的马来亚和位于加里曼丹岛北部的沙捞越、沙巴组成。整体位于太平洋和印度洋之间。
国土总面积约33万平方公里，海岸线长4192公里。全境被南中国海分成东马来西亚（简称东马）和西马来西亚（简称西马）两部分。其中，西马13.2万平方公里，东马19.8万平方公里。西马位于马来半岛南部，北与泰国接壤，南与新加坡隔柔佛海峡相望，东临南中国海，西濒马六甲海峡；东马位于加里曼丹岛北部，与印度尼西亚、菲律宾、文莱相邻；西马和东马最近处相距600海里。
马来半岛地形北高南低，山脉由北向南纵贯，将半岛分成东海岸和西海岸两部分，沿海为冲积平原，中部为山地。东马主要是森林覆盖的丘陵和山地。