由于进口旧机械设备通常为国外企业所淘汰的旧机械设备，因此很多情况下存在着安全、卫生和环境保护等方面的问题，有时甚至不能排除某些境外不法经销商采取欺诈手段，大量向国内倾销洋垃圾的可能。概括起来，主要有以下几个方面的问题：
1个别企业或其代理报关企业对进口旧机械设备的工作程序及相关业务知识不熟悉，不能很好地配合检验检疫部门开展相关工作。
如有的企业未能在机械进关之前办理进口旧机械设备手续，以至产品进来了被迫滞关，既给企业带来不必要的损失，也给检验检疫部门带来了不必要的麻烦；
2 个别企业对进口旧机械设备接受检验的重要性认识模糊。
企业在进口大型二手机械时，怀着侥幸心理逃避装运前检验，在货物打包装船甚至到达境内进行通关，不仅违反了相应的法律法规，还存在安全、卫生、环境保护等隐患的旧机械设备进入了国内，给进口旧机械设备技术处理工作带来了不便。
3 还有一些企业无视国家法律法规和相关政策的规定，进口旧机械设备存在逃、漏检甚至以旧顶新等问题，有的甚至对照法规绕道走。
4 相当一部分企业进口的旧机械设备在生产制造年限或产品的安全、卫生及环保上存在问题。