1937年12月13日，日军在南京及附近地区开始了一场长达6周的有组织、有计划、有预谋的大屠杀，史称“南京大屠杀”。在南京大屠杀中，有超过30万的平民及战俘被日军杀害，无数家庭支离破碎。
据资料显示，日军华中方面军参与了进攻南京的军事行动，司令官为松井石根。华中方面军下辖朝香宫鸠彦率领的上海派遣军和柳川平助率领的第十军。这两支部队，下辖第3师团、第6师团、第9师团、第11师团、第13师团、第16师团、第18师团、第101师团、第114师团，以及步兵第41联队。
在这9个师团加上1个联队中，并非所有日军都参与了制造南京大屠杀。制造南京大屠杀的日军，主要是第6师团、第9师团、第16师团、第18师团、第114师团，以及第3师团和第13师团的一部分。
第6师团又叫熊本师团，其兵员主要来自日本熊本。第6师团是日军在二战爆发前17个常备师团之一，属于甲种师团，是日本陆军中最强悍、最有战斗力的两个师团之一（另一个是第2师团）。
早在1894年中日甲午战争时期，第6师团就入侵过中国。1904年日俄战争爆发后，第6师团在中国旅顺北部登陆，参加了沙河会战和奉天之战。1928年，第6师团第3次在中国山东青岛登陆，并制造了震惊中外的“五三惨案”。可以说，在南京大屠杀之前，第6师团的手上就沾满了中国军民的鲜血。
1937年12月13日，第6师团率先从中华门攻入南京。在师团长谷寿夫的纵容下，第6师团疯狂残杀了大量中国军民，数量达5万人之多。
随后，第6师团参与了徐州会战、武汉会战、湘赣会战、长沙会战等。1942年太平洋战争爆发后，第6师团调往太平洋战场，先后遭到美军和澳大利亚军队的痛击。1945年8月21日，第6师团向澳大利亚军团投降。至于谷寿夫，在日本无条件投降后，以乙级战犯的身份受到南京军事法庭的审判，并于1947年4月26日在南京雨花台被枪决
第9师团成立于1898年，兵员主要来自日本金泽，因此被称为金泽师团。第9师团也是甲种师团，是日军在二战爆发前17个常备师团之一，于1904年登陆中国，参加日俄战争。
1932年“一·二八事变”爆发后，第9师团赴上海参战，在中国军队的顽强抵抗下，遭到沉重打击。战后，日军在上海虹口公园举行庆祝大会。朝鲜义士尹奉吉投掷炸弹，炸死了日军陆军大将白川义则，第9师团师团长植田谦吉中将被炸瞎一只眼睛。
1937年12月9日，第9师团在师团长吉住良辅的率领下，向南京光华门发起攻击，在中国守军的抵抗下，未能前进半步。可是，由于雨花台、紫金山、中华门等地陷落，中国守军全线溃败，南京最终落入日军手中。之后，第9师团参与了南京大屠杀，罪恶滔天。
第9师团于1944年12月调往台湾。日本宣布无条件投降后，第9师团在台湾向中国军队缴械投降。
第16师团成立于1905年，兵员主要来自京都、三重县和奈良县，因此被称为京都师团。1937年9月，第16师团在师团长中岛今朝吾的率领下，在华北塘沽登陆。在南京之战前，第16师团奉命追击从上海撤退的中国军队。在追击途中，一路烧杀抢掠，无恶不作。期间，出现了臭名昭著的“百人斩”事件。
1937年12月10日，第16师团主攻南京中山门。在付出很大的代价后，第16师团于12月13日凌晨攻陷中山门。当时，中国军民正在南京城北的下关江边准备渡江。第16师团用机关枪对中国军民进行扫射，并将俘获的中国军人集体杀害。
南京沦陷后，第16师团对城内的中国军民进行无差别残杀，犯下了累累罪行，是杀害中国军民最多的日军部队。
第16师团先后参与徐州作战、武汉作战，1939年7月调回日本。太平洋战争爆发后，第16师团参与进攻菲律宾之战。在1944年的莱特岛之战中，第16师团参遭到美军毁灭性打击，只剩下600多人。1945年8月10日，第16师团师团长牧野四郎中将被美军击毙。
遗憾的是，参与南京大屠杀的中岛今朝吾在1945年10月25日病死，逃脱了南京军事法庭的审判。
第114师团以第14师团的预备役人员组成，师团长是末松茂治中将。1937年12月11日，第114师团配合第6师团作战，参与进攻雨花台。12月13日，第114师团从中华门、雨花门等处攻入南京，随即对中国军民进行大规模屠杀。
南京大屠杀之后，第114师团继续在中国作战。1939年7月，第114师团被调回日本休整，8月撤销编制。
第18师团设立于1907年11月，曾经在1925年5月1日取消番号废止。1937年9月9日，第18师团重新组建。11月4日，第18师团在师团长柳川平助中将的率领下，在杭州登陆，攻破了中国守军的防线。
随后，第18师团追击败逃的中国守军，并参与了攻打南京之战和南京大屠杀。太平洋战争爆发后，第18师团调往东南亚战场，参与进攻新加坡和缅甸。
1945年8月，第18师团在缅甸南部投降。在这之前的1945年1月，师团长柳川平助因心脏病发作死亡。后来，远东国际军事法庭追加他为乙级战犯。
第6师团、第9师团、第16师团、第18师团、第114师团是南京大屠杀的主要罪魁祸首。此外，第3师团和第13师团的一部分，以及国崎支队也参与了这场大屠杀。
1945年日本无条件投降后，第3师团和第13师团分别在江苏镇江和江西湖口向中国军队投降。国崎支队所在的第5师团，在今天印度尼西亚的塞兰岛向盟军投降。
【参考资料：《人民网：南京大屠杀专题》《金陵晚报》等】