人类体内的细胞存在数百万个复杂的非线性基因相互作用网络。近期的临床研究发现，从癌症到神经衰弱等多个致命型疾病，都是由于多种基因和通路的功能障碍导致的。
针对这一难题， Engine Biosciences公司（简称：Engine）开发了一个利用人工智能技术的生物医学平台，使研究人员和药物开发人员能够比传统方法更快、更有效地揭示疾病背后的基因相互作用机理和生物网络，测试专门针对这些相互作用的疗法，并对精准医学应用进行分析和预测。该公司致力于改善药物发现，率先开展生物网络实验，从而使更多患者从中受益。
据动脉网了解，Engine作为一家新兴生物科技初创企业，成立于2015年，其核心团队来自美国和新加坡。
2018年1月，该公司宣布已经顺利完成一轮1000万美元的种子轮融资，成为东南亚地区有史以来规模最大的种子轮融资之一。本轮融资由通和毓承和丹华资本共同领投。参投方包括全球领先生物制药行业药明康德、EDBi、兰亭投资、百度风投、美国中经合集团和Nest.Bio Ventures。
这项融资将为Engine的多项核心工作提供支持，包括搭建药物发现平台，拓展科研及执行团队，开展公司内部研究以及与合作伙伴创立临床实验。目前公司的合作伙伴包括多家领先的临床研究机构和一家美国财富500强的公司。
传统的药物发现在测试和判断与复杂疾病相关的大量基因相互作用中不但进程缓慢，且代价昂贵，而Engine的平台给这些研究的效率和规模带来了数量级的提升。
通过理解和测试基因之间的相互作用，同时使用机器学习和深度学习算法来分析产生的数据，Engine的平台有能力破译迄今为止一直困扰药物开发者和研究者的复杂生物网络，从而使药物研发过程具有逻辑化。
“生物制药行业需要更好的研发方法，能够更快地为有需要的患者开发出治疗方案。在很多传统的药物研发场景中，我们对于疾病的致病原理及其相应的治疗和预防了解甚少，”Engine的联合创始人兼首席执行官Jeffery Lu提到：“Engine的平台使研究人员不仅能够发现疾病基因间的相互作用，并且能够以一种前所未有的快速、经济和精准的方式来测试针对这些相互作用的治疗方法。”
商业与学术的结合推动公司发展
Engine的联合创始兼CEO Jeffrey Lu在过去十年里拥有丰富的商业和企业家经验。他曾在技术驱动创业公司和价值数十亿美元的公司中担任过企业级管理职位，引领团队开展数据分析，规划战略，以创造高效绩业务为最终目标。
Lu曾在宾夕法尼亚大学获最佳学士学位。毕业之后，Lu在Bain & Company开始了他的第一份工作。
据动脉网了解，Bain & Company作为世界顶尖的商业咨询公司之一，致力于与高级管理人员合作，针对企业文化制作决策，并将想法付之于行动。工作期间，Lu逐渐培养了公司专属的深层数据见解及策略，他坚信数据的开发，学习和运用是变革企业的关键。
在亚洲航空（AirAsia）和全球在线旅游公司AAE Travel的工作期间，Lu的首要任务是建立和管理数据分析团队。同时，他向各个组织介绍并解析了由数据驱动决策的不同案例，专注于利用大数据研究来达成企业数百万美元的收入和利润增长。
多年在航空公司和旅游产业的工作经验使Lu创立了Think Digital Sdn Bhd，并担任其董事长。作为一家位于马兰西亚八打灵再也的私人公司，Think Digital Sdn Bhd主要负责经营低成本航空企业。
此外，Lu也曾在投资公司Goodman Capital担任过联合创始人兼总经理。该公司已投资过十多家位于亚洲和美国的生物科技公司。
Timothy Lu作为Engine的联合创始人、董事长兼科学咨询委员会联合主席，曾在哈佛医学院和麻省理工学院完成了博士和研究生的相关学习。
T.Lu开发了Engine技术平台的关键元素，并在合成系统生物学，基因相互作用映射以及计算机科学/工程方面拥有丰富的专业知识。同时，他也是麻省理工学院副教授，麻省理工学院RLE合成生物学小组的负责人以及麻省理工学院和哈佛大学的重要会员。
T.Lu作为应用合成生物学提供医疗和工业解决方案的先驱，曾获得过众多奖项。其中包括NIH新兴创新奖，美国总统早期科学家和工程师职业奖，NSF职业奖以及埃里森医学基金会老龄新学者奖。
除了在学术和研究方面做出的贡献，T.Lu在商业领域中也小有作为。他曾在个人研究的基础上创立过多家公司，其中包括Sample6 Inc.和Synlogic Inc.。
这两家美国风险投资公司通过合成生物学分别开发了用于食品安全和人类微生物群系的下一代诊断疗法。T.Lu已从多轮融资中为公司筹集了超过1.6亿美元的资金。
Engine的关键方法有哪些？
目前，Engine尚未开发任何产品。其公司的主要目标是加速药物发现，解决医疗保健问题，开发网络生物医学平台以及建立世界级专业团队。
为了解决传统制药所面临的一系列问题，Engine重点围绕以下三个问题进行了假设，思考解决方案，以实现公司目标为核心：
1. 传统药物的开发周期受到复杂生物学影响和 “一对一”实验进行的局限，导致研发时间长、失败率高。如何将“一对一”实验方式改变为“一次全部”实验方式，以完成大规模平行实验为目的？
2. 如果Engine能掌握基因在特定生物环境（比如：疾病）中相互作用的有关数据集，那么精准制药能否会实现？
3. 如果Engine可以使用这些数据集来构建细胞图，那么这一方法是否可作为药物发现的预测引擎？
针对这三个问题，Engine开发的网络生物医学平台从不同角度对其做出了跟进和解答：
1. 速度：公司专有的科技和专利技术为研发过程带来了高速，可扩展和成本的优势。
2. 技术：在破译生物网络期间，高通量生物实验技术的应用将指数型缩放问题化为线型缩放问题
3. 工具：公司专有数据的生成模式结合AI方法使药物发现和医学构建完成更有效的预测和落实。
4. 科技：公司的前沿科技可应用于多种细胞类型和疾病相关迹象，这意味着Engine有能力扩大影响力，拯救全球数百万患者的生命。
Engine受到包括百度风投、药明康德在内的多家资本青睐，其技术已应用于四个领域：
一、药物重新定位，即探究已知药物的新适应症；
二、新靶点开发，即识别引起疾病的生物学因素；
三、根据病人特有基因组成来提供独特治疗方案的精准医疗；
四、生物学通路分析。
Engine与竞争对手的比较
1、Engine与Sangamo BioSciences的比较
作为Engine的最大竞争对手之一，Sangamo BioSciences总部位于美国加利福尼亚州里士满，成立于1995年。Sangamo BioSciences在基因制药，临床科学和产品开发等领域中拥有丰富的经验。
Sangamo BioSciences研发的体内基因编辑方法，以SB-FIX为产品所展示。SB-FIX是治疗血友病B的单一疗法，能够通过基因重组使患者稳定并持续表现出凝血分子IX。
Sangamo公司研发的锌指磷酸酶（ZFN）介导基因编辑技术能够利用白蛋白基因（白蛋白是肝脏特点的“安全位点”）对目标基因进行改造。被锌指磷酸酶（ZFN）编辑之后，目标基因被转换成蛋白质，从而进行了有效治疗。采用这一方法，患者的肝脏能够持续表现出凝血因子IX，达到治疗目的。
Engine与Sangamo BioSciences相比，成立时间短，工作团队小，产品在临床试验方面也尚未成熟。Engine旨在解读生物网络的复杂性，跟据病人特有的基因组成来提供独特的治疗方案，致力于解读数据，实现精准医疗。
然而，Sangamo公司主要是通过研究、学习和编辑基因的方式扼杀疾病因子，帮助患者恢复健康。Engine完成的巨额融资将帮助公司进行更深层的基因研发和数据探索，以实现高效的科技制药为目标。
2、Engine与Recombinetics的比较
Recombinetics位于美国明尼苏达州，是一家将基因编辑技术应用于农业，临床研究以及人造器官领域的顶尖基因编辑公司。通过运用该公司的专利技术TALENs，Recombinetics已实现了多物种的基因编辑。
比如，在爱荷华州的一个农场内，农民会割掉牛角以防止受伤。Recombinetics对农场内的两头犊牛进行了基因编辑，使它们不长出牛角。这也意味着牛也不用忍受割牛角的痛苦过程。
“这就像基因组中的查找、替换功能，”Recombinetics的首席执行官Scott Fahrenkrug表示。“这让我们能够找到物种中存在的天然变异，并迅速采取应用。”
Engine与Recombinetics相比，目标不同，受众群体不一样。Engine主要研发优质新药，为重大疾病和生命科学做出贡献其中包括癌症、神经退行性疾病、自身免疫疾病和皮肤病等。
文|晏语
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