1992年，在日本东京一栋防疫研究室大楼遗址附近发现了一些人体头骨，这些头骨被进行了不同程度的切割，人们推测这些头骨的主人生前曾被用于活体实验。而手法与一只丧心病狂的在中国进行惨绝人寰的人体实验的部队极为相似。这支部队就是731部队，这个防疫研究室的主人名叫石井四郎，而这栋大楼也是后面731杀人部队的雏形。
石井四郎在中国人眼里，被称为大魔头、杀人狂魔，因为他就是在中国犯下了累累血案、臭名昭著的杀人工厂731部队的创立者和负责人。
1925年，联合国于日内瓦发布了《关于禁用赌气或类似毒品及细菌方法作战协定书》的协定。但由于生化武器的威力过于巨大，不光日本和德国在秘密的研制，作为同盟国的英国跟美国，也于1942年在马里兰州设立了一个秘密的生化武器研究基地。而且由美国威斯康辛大学的艾拉.鲍德温博士来主持，但是笔者在网络上只能找到零星的关于艾拉.鲍德温的资料。就是这个人当时手上握着4600万美元的巨额试验经费。
当时艾拉.鲍德温负责的德特里克堡项目是最被美国军部看好的，时任美国总统罗斯福甚至认为德特里克堡项目要比奥本海默所负责的原子弹研究项目，更具毁灭性，更有前途。
1945年，艾拉.鲍德温负责的德特里克堡，在规模和投入上甚至一度超越了研究原子弹的项目。美国政府却始终没能从鲍德温的实验室中看到具体的效果。虽然当时德特里克堡投入了50万只老鼠、猴子等动物进行试验，也生产出了大量的细菌病毒。但是，距离要达到实战还差得很远，原因就是他们的试验始终停留在动物身上。相比日本的731杀人部队，他们的起步晚了8年。
日本军方在战争中注意到两个问题：一、日本是一个岛国，面积狭小，资源缺乏，如果一味靠使用炸弹、子弹、火药等金属武器，势必会陷入军火不足的境地，二、当时日本的侵略方针是先占领中国，继而吞食整个东南亚。
这时，石井四郎四处在日本军部游说细菌武器的杀伤力，以及细菌武器成本的低廉性，这些刚好符合日本军部许多主战派的要求。所以，日本军部一再下令，要以物质和名望来满足石井四郎的需要。
在拿到二十五万日元经费后，石井四郎马上又向军部提出建议，要在中国东北建立细菌实验室，他的理由有三个：一、细菌研究极度危险，如果在日本本国研发，有可能会造成意想不到的灾难；二、为了尽快研制出可以用于战争的细菌武器，急缺用活人试验的材料，而中国东北，当时已经落入日本的统治，在那里可以得到珍贵的活人材料；三、东北当时靠近苏联，而日苏之间形势紧张，大战一触即发，将实验室放置东北，也可随时支援关东军。
1933年，日本陆军部命令石井四郎成立一个秘密军事基地，该基地以研究细菌武器为目的，妄图实现种族灭绝。他们通过使用活人试验的疯狂手段，大肆残杀中国人、朝鲜人以及战俘，当时石井四郎将地址选择在中国东北黑龙江省五常县的背荫河地区。1940年，为了加快活体实验，生产更多的细菌生活武器，石井四郎又在哈尔滨平房区设立了大本营，同时也在中国各地、新加坡等地成立了分部，该部队番号731，这就是731杀人部队。731部队的对外名称先后为“关东军防疫部”和“关东军防疫给水部”；秘匿名称则为“石井部队”、“奈良部队”、“满洲第731部队”等。
731部队当时主要研究的细菌病毒有四种：炭疽菌（这种东西1克就足以杀死数万人）、鼻疽、霍乱、鼠疫菌（可以在某些环境中，如墙壁内、木板上存留超过100年），对人类的威胁可以说是无限期的。731部队当年主要以研究这四种病菌为主，研究这些细菌对人体的危害性，以及如何让人以最快速、最有效率的感染上这些细菌。
当年731部队中很多的实验房间内挖有大坑，坑里面养着感染了大量各种病菌的老鼠，731部队的实验人员通过老鼠身上大量的跳蚤把各种病菌感染到活体实验对象，就是被他们称为“马路大”的人身上，“马路大”在日语中是原木的意思，731部队根本就没有把中国人当成人来看，只是把他们当成切割分解的实验材料。当时通过对上千名细菌感染的活体进行试验观察，石井四郎发现这些细菌病毒，虽然杀伤力大，影响范围广，但是还要解决如何把它们运用到战争当中的问题。
1945年8月15日，日本宣布无条件投降。1946年驻日盟军最高统帅麦克阿瑟成立远东国际军事法庭。在东京进行审判，包括东条英机在内的28名日本甲级战犯，受到了远东军事法庭的审判，审判从 1946年5月3日第一次开庭到1948年11月12日审判完毕。审判期间开庭818次，审判记录共48412页，有419人出庭作证，779人书面作证，受理证据4300余件，判决书长达1213页，从1948年11月4日起宣读判决书，直到12日才读完。
远东国际军事法庭最终判处东条英机等7名甲级战犯绞刑，木户幸一等16名甲级战犯无期徒刑，两名甲级战犯分别被判处20年和7年有期徒刑。另外3名甲级战犯，一名因患精神病中止审判，另外两名因在审判期间死亡免于追究。1948年12月23日凌晨，东条英机等7名战犯被绞死在东京巢鸭监狱的死刑架上。
但是，在这么多的起诉罪行中，里面竟然没有提及 731杀人工厂的罪行，以及包括石井四郎在内的任何一名731部队成员。而且在之后的数十年内，731的罪行以及成员结构的情况，都不被世人所知晓。
那么为什么包括石井四郎在内的所有731部队的成员，都没有出现在东京审判上呢？
前面我们提到由艾拉.鲍德温博士主持的德特里克堡生化武器研究基地，虽然鲍德温他们也生产出了大量细菌病毒，但是距离实战还差很远。面对这个情况，美军迫切地想知道细菌研究起步比他们早近10年的731部队的具体研究成果，而石井四郎就成为了其中的关键。
但是，这时的石井四郎已经消失得无影无踪了，所以美军情报局一边派人到日本进行深入的调查，另一边对731的二号头目内藤良一进行审问。
内藤良一（侵华日军陆军中佐），石井四郎的左膀右臂。他在731部队负责防疫研究所的工作，是731部队二号人物。艾拉.鲍德温从德特里克堡派出了一名同样是学细菌学的博士，对内藤良一进行审讯。但是，内藤良一非常的狡猾，在一开始，他不但不承认有关731部队的任何事情，反而反过来试探那位细菌学博士的目的和动机。
这位美国细菌博士十分恼怒内藤良一的这种行为，于是威胁内藤良一说：“你要是再不老实，就把你当战争犯处决掉。”受到这个威胁的内藤良一，才交代了731的一些罪行。但他转变如此之快的态度，又让美国人怀疑内藤良一先前的举动是不是在拖延时间，好让他的顶头上司石井四郎，能够有足够的应付时间。
1945年8月9日，美军出动B－29轰炸机将代号为“胖子”的原子弹在日本长崎投下，同时，苏联军队发起了远东战役，当日零时十分，苏联以三个方面军约170万大军、5500辆坦克，分四千多公里的战线上越过中苏、中蒙边境，向日本关东军展开全面进攻，而此时距离裕仁天皇宣布日本战败还有6天。此时日本战败已成定局，731部队的处置问题也就提上了日程，所以日本陆军部赶紧着手研究如何销毁731部队的罪证。
当时的日本陆军参谋部作战科总长朝枝繁春，奉命去会见石井四郎，并且对他下达陆军部的决定。迫于多方面的压力，朝枝繁春多年之后不得不承认了自己当年曾下达了摧毁731部队罪证的命令：“请贵部永久地从地球上消失，并请完美的将所有证据毁灭掉。”但是，关于如何毁灭证据的一些细节和步骤，朝枝繁春始终三缄其口，采取沉默的方式来逃避。
《731-石井四郎及细菌战部队揭秘》，日本作家青木富贵子所著，这本书里有诸多朝枝繁春和石井四郎见面交谈的内容，以及密谋销毁证据的细节。朝枝繁春跟石井四郎相谈了一个多小时，一见面朝枝繁春就问还有几个“马路大”，之后做出了四点指示：一、贵部全体解散，让部队成员尽早返回日本本土，所有证据物品都必须永远地从地球上消失的无影无踪；二、为此我已经做出安排，调一个工兵中队，携带五吨炸药归贵部指挥使用，必须将所有的设施炸毁；三、建筑物内的“丸太”（即“马路大”），必须用电动机加以处理，再放进贵部的锅炉内焚烧，然后将其骨灰等投入松花江冲走；四、贵部53名具有博士头衔的军医，必须用贵部军用飞机直接运回日本本土。
石井四郎问了一句说：“研究资料也不能带回去吗？”朝枝繁春当时非常肯定地回答：“为了不给天皇添麻烦，所有资料一页都不能带回去，必须从地球上彻底消失。”石井四郎给部下每人都发完氰化钾之后，又下达了三项任务：一、回到故乡后要永远隐瞒自己曾经在731部队服役的事实；二、不得担任一切公职；三、严禁部队成员间互相联络。最后石井四郎严厉命令731部队的秘密要带进坟墓。
下达完命令，石井四郎命令部队将731的建筑物炸毁，屠杀关押在里面的所有的人员。这些人除了中国人，还有朝鲜等盟军成员，他们都是被当做活体实验品的，这些人被焚烧后的尸体，扔进了松花江。
另外，石井四郎还下令将731部队内用于细菌繁殖的所有老鼠、跳蚤、黄鼠狼放出，这些携带者细菌病毒的动物，后来在中国东北平房区附近22个县，造成了大规模的瘟疫，确切死亡人数已经无从考据，同时，因建筑物被炸毁的731遗址附近，仍埋有大量的细菌病毒，直到现在，国内施工人员在挖掘时，时有被感染的事情发生。这也是日本731部队在中国进行细菌武器研究的铁证。
731部队第四部的成员森下清人描述了一段，关于如何屠杀731部队内关押的活人真相：“我奉了部队长的命令，将“马路大”用BAR-B-Q的方法烧死。”BAR-B-Q翻译为中文就是蒙古烤肉的意思，残忍的731部队成员将他们活活地焚烧致死。
此外，石井四郎还亲自给731部队总部之外的很多分部成员打去电话。石井四郎的女儿石井春海，回忆她父亲电告731支部新加坡分部的增田知贞的话：“队长，请你自杀，也请你把你的家人都杀掉，并把所有的证据毁灭。”
石井四郎要求别人自杀并杀掉家人来保守秘密，那么他又是如何做的呢？
从中国回到日本本土后，石井四郎便隐姓埋名，在新宿开了一家名叫邦邦女郎的艺伎馆，为美国大兵提供艺伎，1946年春天，他还在报纸上发表了自己死亡的一则声明，并且让老家加茂村的人，为他准备一场假葬礼。但是，他不知道的是美国人早在1941年就已经盯上了731部队。
《731-石井四郎及细菌战部队揭秘》中提到，1941年2月25日，美军参谋二部发给参谋部的一份电报：根据可靠情报，日本拥有细菌战部队，他们隶属于生化部队，比例是每两个连队一个大队，有一千多名伞兵，正在接受训练。
美国当时的FBI头子J.埃德加.胡佛，在1942年1月9日，曾致函美国海军情报局：“根据长期居住于东京的可靠情报人员的报告，有多名德国医生正将细菌战的知识，传递给日本人。”
石井四郎的女儿回忆说，1945年8月30日的下午2点05分，驻日盟军最高司令官麦克阿瑟飞抵日本厚木机场，他下飞机问的第一句话就是“石井中将在哪里？”
在内藤良一被审问期间，曾有一位731部队的成员来到石井四郎的邦邦旅馆，并且为他递上了一瓶氢氰酸，他对说石井四郎说：“队长，你自杀吧，连全家一起杀掉。”但是，这个要求手下守口如瓶，如果被抓就要服毒自尽的731头目，石井四郎本人却是个贪生怕死的人，却拒绝服毒。在美国FBI特工找到他时，便乖乖地去接受审讯了。
对于美国而言，掌握日本细菌战的资料，比起诉这些战犯重要得多，美军在发现石井四郎和他的731部队的秘密之后，只想将这些资料秘密的控制起来，而不想将之公之于众。但是美军的这个想法在审问的过程中，却被狡猾地石井四郎发觉了，让他知道了美国人的审问并不是真的要把他送上军事法庭，从他的口中得到731部队的活体实验资料才是美军的真实目的。他顿时就想到了可以跟美国人谈生意。这也就是为什么东京审判时，石井四郎跟他的731部队成员没有出现在远东军事法庭上。
前面提到朝枝繁春要石井四郎销毁731部队的所有痕迹的命令。但是石井四郎真的按照命令执行了吗？当然没有。他偷偷运了八千多张记录着活体实验数据的幻灯片以及许多的胶卷回日本。
石井四郎就是利用这些仅存的资料跟美国的麦克阿瑟谈条件。美军要想获得资料，必须满足他两个条件：一、美军必须保证731部队的所有成员免于起诉；二、自己将作为美国德特里克堡的高级顾问，日后与美方对自己所提供的资料，进行继续深入的研究，而且美方有义务向他提供顾问费用。麦克阿瑟没敢马上答应石井四郎所说的要求，因为731部队所进行的惨绝人寰活人试验，罪行实在是令人发指。仅凭他恐怕并不能保证就能保住石井四郎。
还有一个问题就是，当时苏联向美军提出了要引渡审问石井四郎的要求，作为同盟国的苏联同样有资格审问日本战犯。
在1945年日本战败，石井四郎解散731部队的时候，有一部分731部队成员，在中苏边境被苏联人抓获。731部队成员筱冢良雄向苏联人提供的证词当中供出了731部队是如何培植病毒以及投放病毒的罪行。
有了筱冢良雄的证词，迫使美国同意苏联人对石井四郎进行审问。但美国提出要求，苏联必须派人去日本，并且只能在石井四郎家中审问，整个审问过程美方人员必须全程参与。他们必须确保石井四郎不会在苏联人面前说不该说的话。美国人一是怕苏联人将石井四郎引渡到苏联之后不再归还，二是担心苏联人看中石井四郎掌握的资料。但是，经过几天的审讯，苏联人并没有从石井四郎口中得到什么有用的情报，不得已放弃了对石井四郎的继续审问。
石井四郎为什么要对苏联人守口如瓶呢？他能同美国人做交易，那么同样可以和苏联人做交易。
原来在此之前，麦克阿瑟跟他达成了一项秘密的口头协议，后面这个协议被书面化，被称为《镰仓协议》。签署地就是1947年东京的镰仓酒馆。
美国国家档案局公布的《镰仓协议》分为九条：一、秘密调查报告仅限于希尔博士和驻日盟军总司令部中的美国人，以及石井四郎和约二十名研究人员范围之内；
二、日本研究人员将受到绝对保护，免于追究战犯罪责；
三、报告对苏联人绝对保密，仅供给美国人阅读；
四、对于苏联的起诉以及诸如此类行动将受到绝对保护；
五、报告不得向大众公布；
六、注意不得让研究人员已处于美国保护之下的事实公之于众；
七、可允许主要研究人员前往美国；
八、建立细菌战实验室支付所需经费，可进一步考虑处于美国人领导之下的与日本研究人员共同进行的研究；
九、仅与美国人进行的全面共同研究将对日本问题产生良好的影响。
这个肮脏黑暗的协议签订完之后，美国人按照协议中的约定，聘请石井四郎为德特里克堡高级顾问，并将那里的一栋大楼命名为731，供石井四郎研究使用。后来在石井四郎的怂恿下，德特里克堡最高负责人鲍德温终于突破底线，在美国本土用活人进行了细菌试验。而731的其他成员们也自然因为东京审判时未接受审判，所以闭口不谈731的事情。
不过很多人并没有遵守石井四郎的口训隐居故乡，他们中有很多人在战后又开始发展个人事业。比如内藤良一在战后成立了日本最大的血库储存基地绿十字公司，富可敌国，并且，在绿十字公司六名董事中，有三名都是前731部队成员。
2009年日本NHK电视台对原731部队人员的去向做了跟踪报道，发现这些人基本都在日本各大医药公司、医院、高等学府担任要职。但是真相不会被掩盖，731部队在中国东北所犯下的滔天罪行将会永远被钉在历史的耻辱柱上。