9月13日0—24时，31个省（自治区、直辖市）和新疆生产建设兵团报告新增确诊病例92例。其中境外输入病例33例（云南14例，广东8例，上海6例，四川2例，北京1例，福建1例，山东1例），含5例由无症状感染者转为确诊病例（广东3例，福建1例，四川1例）；本土病例59例（均在福建，其中厦门市32例、莆田市24例、泉州市3例），含12例由无症状感染者转为确诊病例（均在福建）。无新增死亡病例。无新增疑似病例。
莆田三条传播链曝光
9月13日晚，福建莆田市人民政府新闻办公室召开第四场新闻发布会，介绍疫情防控有关情况。
会上通报，截至9月13日20时，莆田市累计报告新冠病毒核酸阳性79例，其中确诊病例58例（普通型21例，轻型37例），无症状感染者21例。
已累计排查出密切接触者1770人，次密切接触者1866人。核酸检测采样855373份样本，已出报告548746份。
仙游县从14日开始进行第二轮全员核酸检测。专家判断，要经过三轮以上全城核酸检测，根据结果再进行判断。
目前的形势比较严峻，体现在两个方面：一是病毒传播速度快，二是感染人群主要集中在小学生和中老年人身上，病例年龄最大84岁，最小5岁。
相关工作人员表示，需要重点关注三个传播链条：第一个是新加坡返莆人员林某杰的家族，第二个是他太太所在工厂（协胜鞋厂），第三个是他的小孩所在的学校（铺头小学）。
厦门全市小区实行闭环管理
截至13日18时，福建厦门累计报告确诊病例12例。13日起，厦门同安区新民镇湖里工业园以东、同明路以西、集安路以南、集贤路以北的区域被列为高风险地区。
13日晚，厦门发布通告：要求全市居民小区（村）实行闭环管理。具体内容如下：
全市居民小区（村）实行闭环管理，严格落实“测温亮码”措施，减少人员流动。封控区实行“区域封闭、足不出户、服务上门”，管控区实行“人不出区、严禁聚集”，防范区实行“强化社会面管控，严格限制人员聚集”。快递、外卖等实行“无接触”配送，物品统一放置到小区（村）指定的存放处。
全市各级党政机关、事业单位实行弹性工作制，应配备适当人员在岗在位，确保各项工作正常运转。出入办公场所严格扫码、测温、戴口罩，具备线上办公条件的提倡线上办公。
请广大市民群众密切关注疫情动态，非必要不离厦。自2021年9月14日零时起，确需离厦的，须凭健康码绿码并持有48小时内核酸检测阴性证明。
在全市范围内暂停中秋博饼、民间信仰、文艺演出等群众性活动；实行“红事”缓办、“白事”简办；暂停各类大规模群体性聚餐活动。
全市所有商场、超市、农贸市场等基本生活物资供应场所合理控制购物人员数量；暂停棋牌室、影剧院、网吧、歌厅、酒吧、台球厅、博物馆、图书馆、健身场所、培训机构等有关室内公共场所的运营活动。
落实出租房、酒店、旅店、民宿（含网约民宿）等经营者的管理主体责任，加强对承租人员的管控，如发现有发热、咳嗽等异常情况必须立刻报告所在社区（村）。
零售药店出售治疗发热、咳嗽等相关药品实行实名制登记，顾客须凭身份证实名登记和购买。
各单位、社区（村）应加强环境清洁消毒工作，强化对电梯、门厅、过道等重点公共区域消杀。
严禁恶意造谣传谣、谎报瞒报疫情、发布不实信息。
国庆前疫情能控制吗？
据国家卫健委派出的赴福建工作组专家判断，目前莆田疫情形势严峻复杂，后续在社区、学校、工厂等人群中继续发现病例的可能性高，疫情存在外溢风险。
不过，专家们研判，只要充分运用此前积累的常态化疫情的成功经验，确保各项措施和各个环节落到实处，疫情规模有望在国庆长假前得到控制。
中国疾控中心相关专家提醒，公众在出行过程中依然要绷紧疫情防控这根弦，保持一定的警惕性。另外，在假期期间，对于聚集和聚会，我们不提倡，尤其是不允许大规模的聚集。公众在出行之前，去目的地时要了解目的地的疫情防控等级，如果是中高风险地区就不能前往，如果您所在地是中高风险地区，也不能出行。