看了一下现在的其它答案，感觉有好多误导。
东南亚现在差不多有十个国家，其中印尼、马来西亚、文莱和新加坡四国的国语事实上都是马来语，只是在印尼这种语言叫印尼语但事实上和马来语基本一样的。这四个国家对中国的称呼情况比较复杂，放在后面说。
其它六个国家里，越南语里中国是汉语“中国”两字的音译Trung Quốc，缅甸语里是渊源很复杂的Tarut，其它几个国家（泰国、老挝、柬埔寨、菲律宾）基本都China的音译，包括泰语里的Jin也可以说是China一词的变异。
而开头提到的四个马来语国家，新加坡因为同时也说中文，所以用中文时自然会将中国称为“中国”，但用马来语时则会和其它马来语国家一样，把中国称为China或者Cina。这两个词是同一个词的不同拼写，其实是一个词，严格的说，如果再音译回来，都是“支那”。但印尼的确实有些特殊，但现在的情况却和网上传的正好相反。
印尼在独立后，1950年和中国建交，自那时起印尼官方就管中国叫Tiongkok，就是中国两字的音译。但后来印尼苏哈托政权发动政变上台后，大肆反华，中国和其断交，印尼1966年开始禁止将中国再称为Tiongkok，而要求只能称为Cina，也就是支那。
1990年中国和印尼恢复外交关系，应中国要求，印尼将中国一词的拼写由Cina改成China，但刚才说了，这个词的本质没变。不过在1998年大排华事件之后，印尼苏哈托政权跨台，新的民选政府则废除了印尼法律里的各种排华条款。在2014年，印尼总统专门发布政令，将印尼语里的中国一词由China正式改为Tiongkok，也就是中国二字的音译。所以现在的印尼反而是马来语国家里唯一将中国称为中国的国家了。
不过官方名称虽然改了，印尼民间一下子还改不过来，多数老百姓还是基于习惯和其它马来语国家一样，把中国称为China或者Cina。