厉害了!合肥综合性国家科学中心创新平台半汤大基因中心极元科技,在美国FDA举办的基因测序数据分析质量评比中,夺得世界第二!
据了解,在这场评比中,共有 30家世界知名的大学/生命科学研究院和基因测序公司参加,包括美国哈佛医学院的Broad Institute、谷歌等机构。
能从如此优秀的全球竞争企业中脱颖而出,尤其是击败美国谷歌等公司,真是大涨国人志气!
更可喜的是,该技术能极大提高新生儿遗传病诊断效率——传统办法要3-4个月才能确定病因,通过绿色超算技术分析样本,只要1天时间就能诊断!
合肥半汤大基因中心地标
FDA基因测序数据分析质量评比第二
2017年7月,在美国药监局 FDA 举办的 Precision FDA Hidden Treasure 基因测序数据分析质量评比上,共有 30家世界知名的大学/生命科学研究院和基因测序公司参加,包括美国哈佛医学院的Broad Institute、谷歌等机构。
基因测序数据分析质量评比得分表
其中,仅有10家机构/公司成功地检测出所有的植入变异和他们对应的Variant Allele Frequency (VAF),其中就包括极元科技(Aginome Scientific)。在对其他变异的分析上,极元科技取得了总分第二好成绩,科研实力迈入国际领先水平。
绿色超算极大提高疾病诊断效率
算法在诊疗中的作用,更让人感到神奇。遗传疾病在新生儿中占有一定的比例,传统诊疗周期长、费用高,现在通过基因检测和绿色超算能将这一局面彻底改变。俞容山博士介绍,“遗传病罕见,复杂症状,传统办法要三四个月才能确定病因,通过基因检测,快速计算,一天时间分析样本就可以诊断。”
绿色超算如此出众的奥秘
绿色超算系统基于独有的GPU/CPU异构并行计算技术,一个绿色超算系统节点处理基因大数据能力约等同于100相似CPU配置服务器组成的集群处理能力,极具创新性和市场竞争力。俞容山博士介绍,“美国另外一家公司靠芯片做到同样的速度,我们在通用计算机通过软件就可以。”
中科院北京基因组研究所专家曾使用自带的全基因组测序数据,对半汤大基因中心绿色超算系统进行了测试。结果显示,对于完成同一个全基因组测序(WGS)数据处理任务,目前业界绝大多数常规通用的超算单节点完成标准流程序列映射(mapping)需要8小时,而绿色超算系统单节点仅用18分钟,运算速度是前者的27倍;变异检测根据可选择流程模块,提高运算速度10-80倍!
绿色超算科学家介绍
半汤大基因中心极元科技CEO俞容山博士
俞容山博士,半汤大基因中心极元科技CEO、厦门大学“闽江学者”特聘教授、数字福建健康医疗大数据研究所所长、IET会士,曾任美国杜比实验室主任研究员、新加坡科技发展局通信资讯研究院信号处理研究所所长和项目首席科学家。
在国际著名学术期刊及会议上发表了70多篇论文。为了表彰他对数字技术发展及国际标准制定所做出的杰出贡献,新加坡科学与技术部于2007年授予其“新加坡国家科技奖”,这是新加坡科技界的最高荣誉。
半汤大基因中心将进入成果爆发期
除了绿色超算之外,半汤大基因中心还有更多尖端科技,汇聚成科技进步的强大力量,有力促进人类健康、长寿、幸福美好愿景的实现!
中国半汤生物谷航拍图
自2017年5月,半汤大基因中心揭牌以来,依托一流的硬件环境、开放的人才政策、雄厚的科研实力,短短一年时间,集聚了基因测序、绿色超算、生物信息分析、DNA数据存储、CAR-T细胞治疗、合成生物学等领域的科学家和博士,构建了测序、算法、解码和应用的基因全产业链,成为安徽乃至中国基因研究与创新发展的生力军。
一批科研成果逐渐崭露头角,2019年将进入科研成果集中爆发期!(来源:“波动未来”微信公众号)