北京时间9月5日，40强赛首轮比赛陆续开打，与国足同组的2场比赛，马尔代夫客场1-0小胜关岛，叙利亚客场5-2大胜菲律宾。B组，中国台北主场1-2不敌约旦，C组中国香港客场1-1战平柬埔寨。
其余较量，D组新加坡2-2战平也门，F组的蒙古1-0小胜缅甸。G组的焦点大战，号称东南亚德比的泰国主场0-0战平越南。
A组：关岛0-1马尔代夫
马尔代夫的马哈德第27分钟，打入全场唯一进球，1-0击败关岛。第2轮，马尔代夫主场迎战国足。
菲律宾2-5叙利亚
叙利亚是国足在A组的头号劲敌，但开场6分钟，菲律宾便由前建业外援哈维尔闪击得手，1-0。第15分钟，索马为叙利亚扳平，1-1。第31分钟，穆巴耶德帮助叙利亚完成反超，2-1。下半场开场仅3分钟，前申花外援哈蒂布操刀主罚点球得手，叙利亚3-1。随后索马头球梅开二度，叙利亚4-1。第84分钟，奥特为菲律宾扳回1球，但2分钟后，马瓦斯帮助叙利亚将比分锁定在5-2。
B组：中国台北1-2约旦
第18分钟，中国台北门将脱手，费萨尔补射空门得手，约旦1-0。第37分钟，森美亚将比分改写为2-0。下半场，效力于北体大的温智浩为中国台北扳回1球，但最终还是1-2告负。
C组：柬埔寨1-1中国香港
本田圭佑挂帅的柬埔寨主场对阵中国香港，第16分钟，陈俊乐为中国香港首开纪录，1-0。第33分钟，索衡低射得手，柬埔寨扳平比分，最终两队1-1战平。
D组：新加坡2-2也门
也门年初参加了亚洲杯，但做客面对新加坡，阿哈马第27分钟为主队打破僵局，1-0。随后阿卜杜瓦西和玛塔里的进球帮助也门2-1完成反超。下半场第52分钟，拉姆利的进球让双方最终2-2战平。
F组：蒙古1-0缅甸
蒙古第一阶段淘汰文莱晋级，凭借Amaraa的制胜球，蒙古1-0战胜缅甸，迎来40强赛的开门红。
G组：泰国0-0越南
这场东南亚德比，双方最终0-0互交白卷，在死亡之组都未能拿到3分，向种子球队阿联酋发起挑战。
H组：朝鲜2-0黎巴嫩
郑日冠上下半场各入1球，最终朝鲜2-0战胜黎巴嫩。