老一辈的新加坡人和马来亚人更认为新马原本就是一体的，是英国人的到来让他们变成了两个不同的地方。当英国人的势力开始消退之后，新加坡和李光耀开始筹备着和马来亚合并，并决心构建一个“马来西亚人的马来西亚”。
很显然，新加坡是需要马来亚的，他们人口只有200万，土地面积只有北京通州那么大，他们必须依赖马来亚的人口、资源、市场等等。但是，马来亚却不这么认为，他们想构建的是一个“马来亚人的马来西亚”，他们不必依赖新加坡那么小的地方，相反，他们觉得大量的新加坡华人的加入会严重影响其种族结构，威胁马来人的地位。
马来西亚国父东姑阿都拉曼就持有这种观点，他一开始很抗拒新加坡的加入，但是英国人告诉他，如今的新加坡左派势力正在逐渐做大，如果你们不接受它，它可能就倒向另一边了。东姑被说服了，但是他有条件，新加坡需和沙巴、沙捞越一起加入马来西亚，因为后面这两个地区都是华人占比较少的地区，可以稀释新加坡带来的冲击。
当时有很多人并不看好新马合并，包括李光耀的夫人柯玉芝女士，但是李光耀没有更好的选择，他必须选择加入马来西亚，并且试着改变它。后来的事情证明李光耀失败了，一年半的时间他们就被赶走了。原因在于李光耀不但不愿意放弃他的主张，还说服了砂拉越、槟城等地的团体加入他们，这对东姑来说是不能接受的，当时东姑告诉李光耀：你们不该打马来人的主意，你们别无选的，只能退出。
李光耀在2013年回忆此事件时说到：当时我大概对东姑的能力和他所扮演的角色过于乐观了……我早该在马来西亚成立之初就看清这一形势。
李光耀承认自己低估了马来人捍卫自己“特权”的决心，但是这绝不意味着他会认同东姑和马来西亚当时的做法，他晚年依旧坚信如果当初东姑如果能够压制住那些马来激进分子，让华人和印度人一起进入马来西亚和它们共享权力，那么马来西亚的现状一定比现在要好很多。
东姑的政策给马来西亚带来的最大影响之一就是，华人和印度人的生存环境受到了很大的压制，他们不得不选择离开，他们去了新加坡、欧美、澳洲等地，而留下来的那些人并不是他们不想离开，而是他们没有能力和条件离开。这些被迫离开的人中不乏各种各样的优秀人才，比如后来在澳大利亚当部长的黄英贤。从长远的角度来看，正是那种民族主义害了马来西亚，这相当于自断一臂，自己毁掉了自己的人才库。
2009年，拉扎克当选马来首相，不久之后他就推出了“一个马来西亚”的政策，他希望以此重新拾起华人和印度人对他们的信任，他们也试着重新把那些流失了的人再次吸引回来，但是真的有那么容易吗？马来人真的愿意放弃自己的特权？这种根深蒂固的特权观念真的能够被消除吗？